RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 CHST11Q9NPF2 352 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 COPS7AQ9UBW8 275 aa13.14□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 ACY1Q03154 408 aa13.12□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 SSC4DQ8WTU2 575 aa13.12□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 C5orf34Q96MH7 638 aa13.12□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 IFNA17P01571 189 aa13.12□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF17P17021 662 aa13.12□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 ZNF565Q8N9K5 539 aa13.12□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.12□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 PISDQ9UG56 409 aa13.12□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 DMRT1Q9Y5R6 373 aa13.12□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 E5RGE8 158 aa13.11□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 SLC2A1P11166 492 aa13.11□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 COL19A1Q14993 1142 aa13.11□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 GINS3Q9BRX5 216 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 PECRQ9BY49 303 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35B3Q9H1N7 401 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 FGF21Q9NSA1 209 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 POLR1DQ9Y2S0 133 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 NSG2Q9Y328 171 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINE3A8MV23 424 aa13.11□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 SCGB1D2O95969 90 aa13.11□□□□□ -0.31
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TOP3B-206ENST00000436282 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35A1P78382 337 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 LCN10Q6JVE6 187 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 CD300LFQ8TDQ1 290 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 ST8SIA1Q92185 356 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 GNRHR2Q96P88 292 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 PBDC1Q9BVG4 233 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 GGACTQ9BVM4 153 aa13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa13.1□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 MASP2O00187 686 aa13.1□□□□□ -0.31
TOP3B-206ENST00000436282 LMO1P25800 156 aa13.1□□□□□ -0.31
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