RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 PTX4Q96A99 478 aa15.61■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 TCFL5Q9UL49 500 aa15.61■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 SCN2AQ99250 2005 aa15.61■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 SCGB1D2O95969 90 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 TIMP1P01033 207 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 GPR18Q14330 331 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 PCK2Q16822 640 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 TSLPQ969D9 159 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB118Q96PH6 123 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 RPH3ALQ9UNE2 315 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 YIPF1Q9Y548 306 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 XKRY2A2RUG3 117 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 XKRYO14609 159 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 SRP19P09132 144 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 S100A7P31151 101 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.6■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM238C9JI98 176 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 SCGB1D1O95968 90 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 PPBPP02775 128 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 P2RY1P47900 373 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 DNASE1L1P49184 302 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 PRPS1P60891 318 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 SQSTM1Q13501 440 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 NRSN1Q8IZ57 195 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 LPAR4Q99677 370 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 ALPK2Q86TB3 2170 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 A6NCN8 305 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 CBY3A6NI87 242 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 FOLR1P15328 257 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 GLRA1P23415 457 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 FPR2P25090 351 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 CHRNB4P30926 498 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 GABRA3P34903 492 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 RND3P61587 244 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 PMS2P11Q13670 270 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 SLC17A1Q14916 467 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 FCRL6Q6DN72 434 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 SLC8B1Q6J4K2 584 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 LRP11Q86VZ4 500 aa15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 IL33O95760 270 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 UMODP07911 640 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 CCL5P13501 91 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 FSTP19883 344 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 RND2P52198 227 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 CTXN1P60606 82 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 UNC119Q13432 240 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 FDX2Q6P4F2 183 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 AMZ2Q86W34 360 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 RNF208Q9H0X6 261 aa15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.09
GLIS1-202ENST00000628545 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 IGHEP01854 428 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 C1orf100Q5SVJ3 147 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 LYG1Q8N1E2 194 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 HAS2Q92819 552 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM18Q96B42 140 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 OR8B4Q96RC9 309 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 B3GAT1Q9P2W7 334 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 GPR34Q9UPC5 381 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 USP34Q70CQ2 3546 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 HSPB2A8KAH6 182 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 CEACAM18A8MTB9 384 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 MMP16P51512 607 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 HSPB2Q16082 182 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 Q7L0L9 218 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 TP53RKQ96S44 253 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 FKBP11Q9NYL4 201 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 B9D1Q9UPM9 204 aa15.58■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 FANCMQ8IYD8 2048 aa15.57■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.57■□□□□ 0.08
GLIS1-202ENST00000628545 MEGF11A6BM72 1044 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms