RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267970.8

TSPAN3-201, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN3, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-201ENST00000267970 XKRY2A2RUG3 117 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 HOXC13P31276 330 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 PSMB2P49721 201 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 DIO1P49895 249 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 SELENBP1Q13228 472 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CDK5R1Q15078 307 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 PYCR3Q53H96 274 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 SMUG1Q53HV7 270 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NHLRC2Q8NBF2 726 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 JAM3Q9BX67 310 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FBXO34Q9NWN3 711 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NPTNQ9Y639 398 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 BCL2L11O43521 198 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CDC14BO60729 498 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 GFERP55789 205 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC17A1Q14916 467 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CA13Q8N1Q1 262 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 AKIP1Q9NQ31 210 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TREM2Q9NZC2 230 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF785A8K8V0 405 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CHRNA7P36544 502 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 GALR1P47211 349 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FCRL6Q6DN72 434 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 COL19A1Q14993 1142 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ST3GAL2Q16842 350 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 STUMQ69YW2 141 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 RIMKLAQ8IXN7 391 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 GALNT16Q8N428 558 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 BOD1Q96IK1 185 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TAS2R45P59539 299 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 PPP2CBP62714 309 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 PPP2CAP67775 309 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 EPXP11678 715 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 MOB3AQ96BX8 217 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 RNF24Q9Y225 148 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 POMT1Q9Y6A1 747 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CD1EP15812 388 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 COX5AP20674 150 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 PPP1CBP62140 327 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 M1APQ8TC57 530 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CDCA4Q9BXL8 241 aa15.15■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 DEFB109BQ30KR1 87 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM97Q5BJF2 176 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 PTOV1Q86YD1 416 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ONECUT1Q9UBC0 465 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 DUSP8Q13202 625 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 FBXL6Q8N531 539 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ANKRD53Q8N9V6 530 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ASB13Q8WXK3 278 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 LYRM4Q9HD34 91 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 SNCGO76070 127 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 RRADP55042 308 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 OR1L4Q8NGR5 311 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 GPX8Q8TED1 209 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF391Q9UJN7 358 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ADH4P08319 380 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 HES3Q5TGS1 186 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 C5orf52A6NGY3 159 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 CSN3P07498 182 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 FMODQ06828 376 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 FOXF1Q12946 379 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 RFESDQ8TAC1 157 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 NDFIP1Q9BT67 221 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 EGLN1Q9GZT9 426 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 NDRG3Q9UGV2 375 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 A0A1W2PRD5 423 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 A0A1W2PRF3 423 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 A0A1W2PRM7 423 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ADAM20O43506 726 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 RAB1AP62820 205 aa15.13■□□□□ 0.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 203.8 ms