RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
MSE1	YOL033W	MRPL8	P22353	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	HIR1	P32479	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MRP4	P32902	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SLA2	P33338	968 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ALG3	P38179	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YJR061W	P40355	935 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	NEO1	P40527	1151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	AGE2	P40529	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SGM1	P47166	707 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SAM37	P50110	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YGL242C	P53066	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	FYV6	P53913	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PLP1	Q04004	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SGD1	Q06132	899 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ESC2	Q06340	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	FLP1	P03870	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ADH4	P10127	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PUT4	P15380	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	NPP1	P25353	742 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	TFA2	P36145	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	DSS1	P39112	969 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	GEM1	P39722	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	GIP2	P40036	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	TMA108	P40462	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SYG1	P40528	902 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	BNA6	P43619	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ABM1	P47146	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ENT3	P47160	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	DML1	Q03652	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	IVY1	Q04934	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SPC2	Q04969	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RSC58	Q07979	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	REX3	Q12090	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	GLO4	Q12320	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	TSC11	P40061	1430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PDR18	P53756	1333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MYO4	P32492	1471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	COB	P00163	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MSP1	P28737	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MCM2	P29469	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SEC66	P33754	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	CPR5	P35176	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SRL3	P36167	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	POP7	P38291	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YHL012W	P38709	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YHL008C	P38750	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	VPS8	P39702	1274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PKP1	P40530	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YJL049W	P47048	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	TOM22	P49334	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	DYN3	Q04949	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	DCS1	Q06151	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PHO92	Q06390	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
MSE1	YOL033W	ICL2	Q12031	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	BUG1	Q12191	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MED1	Q12321	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	STE3	P06783	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RDS1	P25611	832 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	CCZ1	P38273	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MSG5	P38590	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	JEM1	P40358	645 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YIL092W	P40497	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	THI12	P42883	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	THI5	P43534	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YJR124C	P47159	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	THI11	P47183	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ZIP2	P53061	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YGR266W	P53326	701 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.1 ms