RNA–Protein interactions for RNA: YJR159W

SOR1, Transcript of Sorbitol dehydrogenase, yeast

Gene SOR1, Length 1,074 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOR1	YJR159W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	TCD1	P38756	429 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	CCC2	P38995	1004 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	YEL075C	P39972	122 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	YEL023C	P39992	682 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	FMP10	P40098	244 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	YFL052W	P43551	465 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	STU2	P46675	888 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	POL31	P46957	487 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	MND1	P53102	219 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	YGR111W	P53265	400 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	JJJ1	P53863	590 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	GYL1	Q04322	720 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	SIL1	Q08199	421 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	KAR3	P17119	729 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	PSY2	P40164	858 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	NUT1	P53114	1132 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	HEH2	Q03281	663 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	ARO80	Q04052	950 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	YDR222W	Q04925	415 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	DAS2	Q12084	232 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	JIP3	O13555	125 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	TPK1	P06244	397 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	SRB4	P32569	687 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	HMT1	P38074	348 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	TDA3	P38758	523 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	ASG7	P46993	209 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	TAF10	Q12030	206 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SOR1	YJR159W	ERG11	P10614	530 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	HXT1	P32465	570 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	SLA2	P33338	968 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	KDX1	P36005	433 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	HIS2	P38635	335 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	DSE1	P40077	573 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YIR016W	P40572	265 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YML083C	Q04526	418 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	PRM6	Q04705	352 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	VAC14	Q06708	880 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	MDM38	Q08179	573 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	TRE1	Q08919	783 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	MAS1	P10507	462 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	BCH2	P36122	765 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.07	□□□□□ -0.48	not detected
SOR1	YJR159W	HOP2	P53187	214 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.07	□□□□□ -0.48	not detected
SOR1	YJR159W	HRT3	Q12347	344 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	CKI1	P20485	582 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	URK1	P27515	501 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	BLI1	P35727	113 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YBR056W	P38081	501 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YMC2	P38087	329 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YBL036C	P38197	257 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	INP52	P50942	1183 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	KAP114	P53067	1004 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	VPS54	Q12071	889 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	MCM16	Q12262	181 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	EMP46	Q12396	444 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	APM4	Q99186	491 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	DBF4	P32325	704 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	SEG2	P34250	1132 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YBR284W	P38150	797 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	APM2	P38700	605 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	BRO1	P48582	844 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	PUS2	P53167	370 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YNL011C	P53980	444 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	SML1	Q04964	104 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	GPM2	Q12008	311 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	BI2	P03873	423 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	BI4	P03879	638 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	MRP4	P32902	394 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	TKL2	P33315	681 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	SPC72	P39723	622 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	TGL3	P40308	642 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	NDC80	P40460	691 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	PFD1	P46988	109 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	BOP3	P53958	396 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	ADA2	Q02336	434 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	SPO71	Q03868	1245 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	DDC1	Q08949	612 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	IDI1	P15496	288 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	RRT2	P38332	387 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	RGD1	P38339	666 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SOR1	YJR159W	TAF1	P46677	1066 aa		12.03	□□□□□ -0.48

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.4 ms