RNA–Protein interactions for RNA: YJL112W

MDV1, Transcript of Peripheral protein of cytosolic face of mitochondrial outer membrane, yeast

Gene MDV1, Length 2,145 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDV1	YJL112W	SFI1	Q12369	946 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	MET17	P06106	444 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
MDV1	YJL112W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	MIH1	P23748	554 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	SGF29	P25554	259 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	MLF3	P32047	452 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	NAS2	P40555	220 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	MPH1	P40562	993 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	SPO1	P53541	631 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	CBK1	P53894	756 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	YML119W	Q03208	357 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	GAD1	Q04792	585 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	YOR296W	Q08748	1289 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ATP12	P22135	325 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	SED4	P25365	1065 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ATG19	P35193	415 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	OAF3	P36023	863 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PIM1	P36775	1133 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	APM3	P38153	483 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	YBR287W	P38355	427 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	TDA3	P38758	523 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PUG1	P40100	303 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	KHA1	P40309	873 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	AGX1	P43567	385 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	YJR098C	P47139	656 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	CIK1	Q01649	594 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	RMT2	Q03305	412 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	LCD1	Q04377	747 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	OPT2	Q06593	877 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	OMS1	Q06668	471 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	APL4	Q12028	832 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ISA2	Q12425	185 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	SKS1	Q12505	502 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	MRPL25	P23369	157 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	STE50	P25344	346 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ADP1	P25371	1049 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	GPI10	P30777	616 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	EXO5	P38289	585 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	CTF18	P49956	741 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	YPL107W	Q02873	248 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PHO92	Q06390	306 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	NUR1	Q12066	484 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	HAL9	Q12180	1030 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	RTN2	Q12443	393 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
MDV1	YJL112W	OM45	P16547	393 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	KAR3	P17119	729 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ERT1	P38140	529 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	FAT1	P38225	669 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	IFA38	P38286	347 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PPE1	P38796	400 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	FCP1	Q03254	732 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	HPF1	Q05164	967 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	FRE6	Q12473	712 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ARG3	P05150	338 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	NUC1	P08466	329 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PRP28	P23394	588 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	PHO3	P24031	467 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ADK2	P26364	225 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	KAP122	P32767	1081 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	YHR202W	P38887	602 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	RTS1	P38903	757 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ICP55	P40051	511 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	YIL165C	P40446	119 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	LCB2	P40970	561 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	LYS14	P40971	790 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	not detected
MDV1	YJL112W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	VTC4	P47075	721 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MDV1	YJL112W	NUP84	P52891	726 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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