RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W NGG1P32494 702 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W YKL077WP36081 392 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W GLY1P37303 387 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W CCZ1P38273 704 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SBE2P42223 864 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W CIR1P42940 261 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SPO74P45819 413 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W NUP85P46673 744 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W VTC4P47075 721 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W ASK10P48361 1146 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W ECM9Q02202 377 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W EAR1Q03212 550 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W FCP1Q03254 732 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W RSC2Q06488 889 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W AOS1Q06624 347 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W GUP2Q08929 609 aa7.38□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SAC3P46674 1301 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SEM1O94742 89 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W MET8P15807 274 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W HSL7P38274 827 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SPC72P39723 622 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W YER156CP40093 338 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W RIC1P40395 1056 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W BNA2P47125 453 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W VPS9P54787 451 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W EST2Q06163 884 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W RSC3Q06639 885 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W TY1A-DR3Q12441 440 aa7.37□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W RPC40P07703 335 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W FUS1P11710 512 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W HMG1P12683 1054 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W RPN2P32565 945 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W MTH1P35198 433 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SHM2P37291 469 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SAW1P39735 261 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W TPA1P40032 644 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W ROG3P43602 733 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W EAF6P47128 113 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W HNT2P49775 206 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W YNR040WP53736 256 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SQS1P53866 767 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W TIM10P87108 93 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SEC5P89102 971 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data7.36□□□□□ -1.23not detected
YHC3YJL059W MRPL13Q02204 264 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W LCD1Q04377 747 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W GLO4Q12320 285 aa7.36□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data7.35□□□□□ -1.23not detected
YHC3YJL059W HOP1P20050 605 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W YRO2P38079 344 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W EXO5P38289 585 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W UBP7P40453 1071 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W FYV8P46949 817 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W PPT1P53043 513 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W DAM1P53267 343 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W SFB2P53953 876 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W YHM2Q04013 314 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W APC5Q08683 685 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W ARP7Q12406 477 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W ISA2Q12425 185 aa7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W URB1P34241 1764 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W NUC1P08466 329 aa7.34□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W PMS1P14242 873 aa7.34□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data7.34□□□□□ -1.23 RIP-Chip
YHC3YJL059W SAP4P53036 818 aa7.34□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W BNI5P53890 448 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W CBK1P53894 756 aa7.34□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W HLR1Q04429 423 aa7.34□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W YDL073WQ07454 984 aa7.34□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W CDC45Q08032 650 aa7.34□□□□□ -1.23
YHC3YJL059W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W IME2P32581 645 aa7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W MDL1P33310 695 aa7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W CNS1P33313 385 aa7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W RPN10P38886 268 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W DPH1P40487 425 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W MOT3P54785 490 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W NHX1Q04121 633 aa7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W YDR338CQ05497 695 aa7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W VHS3Q08438 674 aa7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data7.33□□□□□ -1.24not detected
YHC3YJL059W NUR1Q12066 484 aa7.33□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W CDC16P09798 840 aa7.32□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W CKA1P15790 372 aa7.32□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W ADD66P36040 267 aa7.32□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W ATG14P38270 344 aa7.32□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W RTT105P40063 208 aa7.32□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W PCL7P40186 285 aa7.32□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
YHC3YJL059W HST1P53685 503 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.9 ms