RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	TAH11	P47112	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	AIM14	P53109	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	UGO1	Q03327	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	CDC43	P18898	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	YKR018C	P36114	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	APT2	P36973	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	ATF1	P40353	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	PCL10	P53124	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	MCM21	Q06675	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	PCL2	P25693	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	PEX2	P32800	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	UBS1	P38290	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	YNL195C	P40168	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	BNR1	P40450	1375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	YAP1802	P53309	568 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	ATG33	Q06485	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	NTG2	Q08214	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	MLH3	Q12083	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX18	YHR160C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	HMG1	P12683	1054 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	PPZ2	P33329	710 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	PHO11	P35842	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	MNN4	P36044	1178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	PHO12	P38693	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	YJL206C	P39529	758 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	NDC80	P40460	691 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	BPT1	P14772	1559 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	YTA7	P40340	1379 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	GID8	P40208	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	COX18	P53239	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	FHN1	P53279	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	REC102	Q02721	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	ECM3	Q99252	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	SFL1	P20134	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	OSW7	P43611	510 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TAF3	Q12297	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TAF2	P23255	1407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	EMP70	P32802	667 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	FLO10	P36170	1169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	PEX1	P24004	1043 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	DMC1	P25453	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	GLG1	P36143	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	CTR1	P49573	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	USV1	Q12132	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	SET3	P36124	751 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	APN2	P38207	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	ARG2	P40360	574 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	YIL166C	P40445	542 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	MET13	P53128	600 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	ATG4	P53867	494 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	TFB2	Q02939	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PEX18	YHR160C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PEX18	YHR160C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PEX18	YHR160C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PEX18	YHR160C	BCS1	P32839	456 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.8 ms