RNA–Protein interactions for RNA: YFR032C

RRT5, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene RRT5, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT5	YFR032C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	DSE1	P40077	573 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	YIR014W	P40570	242 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	NIS1	P53939	407 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	SLX4	Q12098	748 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	RRT12	P25381	491 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	GCN5	Q03330	439 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	FLC1	Q08967	793 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	CSE1	P33307	960 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	SPT23	P35210	1082 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	CTM1	P38818	585 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	FIG4	P42837	879 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	COS5	P47187	383 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	SCJ1	P25303	377 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	MSH2	P25847	964 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	CBF2	P32504	956 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	AVT2	P39981	480 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	ATG12	P38316	186 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	YBR225W	P38321	900 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	TOF2	Q02208	771 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	SEG1	Q04279	960 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	COG4	Q06096	861 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RRT5	YFR032C	CDC42	P19073	191 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	VBA3	P25594	458 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	DAL1	P32375	460 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	VBA5	P36172	582 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	GUF1	P46943	645 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	CPR7	P47103	393 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	NBP2	Q12163	236 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	DSS4	P32601	143 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	BCD1	P38772	366 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	FHL1	P39521	936 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	VPS70	P47161	811 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	SAM3	Q08986	587 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	ELM1	P32801	640 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	HST1	P53685	503 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	CWC24	P53769	259 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	YCG1	Q06680	1035 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	APC5	Q08683	685 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	SWE1	P32944	819 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	KIC1	P38692	1080 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	RSM25	P40496	264 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	YPT11	P48559	417 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	NMA2	P53204	395 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	YOL075C	Q08234	1294 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	YDL206W	Q12424	762 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	ECM3	Q99252	613 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	RGR1	P19263	1082 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	KIN3	P22209	435 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	XRS2	P33301	854 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	HSP78	P33416	811 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	YMC2	P38087	329 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	BDH2	P39713	417 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	PPM1	Q04081	328 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	KEX1	P09620	729 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	REV1	P12689	985 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	PSO2	P30620	661 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	RMD8	P43620	662 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	LSC2	P53312	427 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	DDC1	Q08949	612 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RRT5	YFR032C	SSP1	P38871	571 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	YER130C	P39959	443 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	CDC1	P40986	491 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	YNR065C	P53751	1116 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	YLR297W	Q05899	129 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	OSW5	P40219	148 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	MND1	P53102	219 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	YPL014W	Q02606	381 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RRT5	YFR032C	TRE1	Q08919	783 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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