RNA–Protein interactions for RNA: YAL017W

PSK1, Transcript of PAS domain-containing serine/threonine protein kinase, yeast

Gene PSK1, Length 4,071 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSK1	YAL017W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CDC42	P19073	191 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	GRR1	P24814	1151 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	LOT5	P34234	306 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SIF2	P38262	535 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	LSB1	P53281	241 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YGR266W	P53326	701 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ADA2	Q02336	434 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PNG1	Q02890	363 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RMT2	Q03305	412 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SNO4	Q04902	237 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	GUP2	Q08929	609 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HSP32	Q08992	237 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	OM45	P16547	393 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ROX1	P25042	368 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SGF29	P25554	259 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YRO2	P38079	344 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HXT7	P39004	570 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YEL025C	P39991	1188 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SKY1	Q03656	742 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ARP9	Q05123	467 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PEX15	Q08215	383 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RTN2	Q12443	393 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HSM3	P38348	480 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	BUD16	P39988	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RAD26	P40352	1085 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PSF2	P40359	213 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RSF1	Q05043	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ARR2	Q06597	130 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	TY3A-G	Q12173	290 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	TY3A-I	Q99219	290 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	TPK1	P06244	397 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	STE50	P25344	346 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	NPP1	P25353	742 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YER010C	P40011	234 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PUG1	P40100	303 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	NAS2	P40555	220 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RRN7	P40992	514 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SPO74	P45819	413 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ENT3	P47160	408 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PCD1	Q12524	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ADH4	P10127	382 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SDH2	P21801	266 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	DMC1	P25453	334 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	STB6	P36085	766 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MUP3	P38734	546 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PPE1	P38796	400 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
PSK1	YAL017W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PKP1	P40530	394 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	TIM50	Q02776	476 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RRN5	Q02983	363 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	UFO1	Q04511	668 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ISU2	Q12056	156 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	BMT6	Q12291	365 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	ARP7	Q12406	477 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	APE1	P14904	514 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MLF3	P32047	452 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	KAP122	P32767	1081 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SRP101	P32916	621 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HXT10	P43581	546 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MET12	P46151	657 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	YJR039W	P47107	1121 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	HAP5	Q02516	242 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	APL4	Q12028	832 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	STE13	P33894	931 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
PSK1	YAL017W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	FET5	P43561	622 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PSK1	YAL017W	SRC1	Q03707	834 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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