RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	GIC1	P38785	314 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	TMA108	P40462	946 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YJL055W	P47044	245 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RSM26	P47141	266 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YDL183C	P48569	320 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YPL071C	Q02864	156 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YLR149C	Q99296	730 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PDX1	P16451	410 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	HXT4	P32467	576 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YKU70	P32807	602 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YKR018C	P36114	725 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YBR287W	P38355	427 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PSD1	P39006	500 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PIK1	P39104	1066 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YEL057C	P39983	233 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	LSB6	P42951	607 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YNR071C	P53757	342 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ALF1	P53904	254 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	HDA1	P53973	706 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YPS7	Q06325	596 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	LAP2	Q10740	671 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	XRS2	P33301	854 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CDS1	P38221	457 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	FET5	P43561	622 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SAE2	P46946	345 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RCF1	Q03713	159 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	THI72	Q08579	599 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SKS1	Q12505	502 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	DAL7	P21826	554 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RER1	P25560	188 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PER1	P25625	357 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CCZ1	P38273	704 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MNT2	P53059	558 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SLD3	P53135	668 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	JJJ1	P53863	590 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	NGL3	Q03210	505 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	STP4	Q07351	490 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	REX3	Q12090	404 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SPO21	Q12411	609 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	AI1	P03875	834 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MRP7	P12687	371 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	FPS1	P23900	669 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	REC104	P33323	182 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MTH1	P35198	433 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	UBP13	P38187	747 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YLF2	P38746	405 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GYP7	P48365	746 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	NHX1	Q04121	633 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YDR306C	Q06640	478 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	TGL5	Q12043	749 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	MET17	P06106	444 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ADK2	P26364	225 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YME1	P32795	747 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CEM1	P39525	442 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	EMP65	P40085	556 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YFL066C	P43538	392 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YFL052W	P43551	465 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SPO74	P45819	413 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ASK10	P48361	1146 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	PPT1	P53043	513 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	VPS75	P53853	264 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	TLG1	Q03322	224 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YLR287C	Q05881	355 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	NMD4	Q12129	218 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CKA1	P15790	372 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	DAP2	P18962	818 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	SED4	P25365	1065 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	RTT105	P40063	208 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	YIL092W	P40497	633 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	CIR1	P42940	261 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	HNT2	P49775	206 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AI2	Q0055	IMA1	P53051	589 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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