RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC37AA6NMS7 1700 aa29.76■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.36
CAPNS1-214ENST00000592483 ECE2O60344 883 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRP10Q86W26 655 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF1P21675 1872 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 NEXNQ0ZGT2 675 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE3AQ14432 1141 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 C6orf229H3BNL8 230 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 VIL1P09327 827 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 TM4SF4P48230 202 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 POLLQ9UGP5 575 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3TC1Q8TE82 1336 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 DOK7Q18PE1 504 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 EYA3Q99504 573 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 F6X3S4 739 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 TCIRG1Q13488 830 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 SCARF1Q14162 830 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 LINS1Q8NG48 757 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 FKTNO75072 461 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-214ENST00000592483 GPSM2P81274 684 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 PLIN1O60240 522 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH1L1O75891 902 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 MOB2Q70IA6 237 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 BEND3Q5T5X7 828 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 MYD88Q99836 296 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 ISCA1Q9BUE6 129 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 AGBL3Q8NEM8 1001 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 SCN9AQ15858 1988 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF609O15014 1411 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 SREBF2Q12772 1141 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-214ENST00000592483 POTEFA5A3E0 1075 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 NEURL1BA8MQ27 555 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV5-2P06315 115 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 TNNQ9UQP3 1299 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 G3V3G9 751 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 RLBP1P12271 317 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 PANK1Q8TE04 598 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 HTTP42858 3142 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L8P0C7I0 530 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 GMLQ99445 158 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH1A1P00352 501 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS8P62241 208 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 GCKRQ14397 625 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM17Q9Y577 477 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM89AQ96GI7 184 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 UTYO14607 1347 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 GRM8O00222 908 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 NF2P35240 595 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 COG6Q9Y2V7 657 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 CENPFP49454 3210 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 UFL1O94874 794 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
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