RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 TTLL8A6PVC2 850 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 HSD3B2P26439 372 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPROQ16827 1216 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 NLRP13Q86W25 1043 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 RELL1Q8IUW5 271 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 MKL1Q969V6 931 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 IFT140Q96RY7 1462 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 F6X3S4 739 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 EFSO43281 561 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 UPP2O95045 317 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 GSTT1P30711 240 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 ETFBP38117 255 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CTC1Q2NKJ3 1217 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 NLRP8Q86W28 1048 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP63Q96MT8 703 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 RUBCNLQ9H714 662 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 BRD7Q9NPI1 651 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 FMN1Q68DA7 1419 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 IQGAP2Q13576 1575 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PP55 124 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CLSTN1O94985 981 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 BMP1P13497 986 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 PWP1Q13610 501 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNB2Q92953 911 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM74Q96NL1 305 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 GSX2Q9BZM3 304 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 GPAMQ9HCL2 828 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 GINM1Q9NU53 330 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFATQ9P243 1243 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 GRIN2BQ13224 1484 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 HECW1Q76N89 1606 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF4O43474 513 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB11FIP3O75154 756 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 F11P03951 625 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 EPB42P16452 691 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 OR13H1Q8NG92 308 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 PMEPA1Q969W9 287 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TCF12Q99081 682 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.81□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNB3Q8WWL7 1395 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 ENPP3O14638 875 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 MARCH6O60337 910 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 MMP20O60882 483 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SASH3O75995 380 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF4AO95239 1232 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM157BP0CG42 384 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 CES1P23141 567 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SOX9P48436 509 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 IGBP1P78318 339 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 GRIN2CQ14957 1233 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP42Q96MM3 310 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 NT5C1AQ9BXI3 368 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 EHD4Q9H223 541 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.8□□□□□ -1.48
CAPNS1-210ENST00000590211 STRN4Q9NRL3 753 aa5.8□□□□□ -1.48
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