RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544484.5

CHD4-211, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHD4, Length 6,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4-211ENST00000544484 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.073e-7■□□□□ 10.3
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CHD4-211ENST00000544484 ZNF790Q6PG37 636 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.64□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 IL13P35225 146 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 WDR62O43379 1518 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 AKR1B10O60218 316 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 BICD1Q96G01 975 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 TBX22Q9Y458 520 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 TRIM75PA6NK02 468 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 CTNNA2P26232 953 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 RMND1Q9NWS8 449 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 CAVIN2O95810 425 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 RUFY3Q7L099 469 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 ERMNQ8TAM6 284 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 PTGS1P23219 599 aa14.61□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 RTL1A6NKG5 1358 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 SKILP12757 684 aa14.6□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 DRC1Q96MC2 740 aa14.6□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 ADAMTS12P58397 1594 aa14.6□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.59□□□□□ -0.07
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CHD4-211ENST00000544484 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 EYA2O00167 538 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 GRM1Q13255 1194 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 FERMT2Q96AC1 680 aa14.59□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 USP19O94966 1318 aa14.58□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 TYRO3Q06418 890 aa14.58□□□□□ -0.07
CHD4-211ENST00000544484 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
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