RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TYRO3	Q06418	890 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	PLCH2	O75038	1416 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	CPB1	P15086	417 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	GLB1	P16278	677 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	GTF2I	P78347	998 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	CCIN	Q13939	588 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF358	Q9NW07	568 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	NGLY1	Q96IV0	654 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	GPR37L1	O60883	481 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TGFB1	P01137	390 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	NFKB1	P19838	968 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	JAG1	P78504	1218 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TTC9	Q92623	222 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	CHD4	Q14839	1912 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	PRELP	P51888	382 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	KIF14	Q15058	1648 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007		F8W735	103 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	DLL1	O00548	723 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	VAC14	Q08AM6	782 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	TNR	Q92752	1358 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MRPL48-208	ENST00000537007	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	MAP3K6	O95382	1288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	SKI	P12755	728 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	NFIA	Q12857	509 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ATP7A	Q04656	1500 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	ALX3	O95076	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	SPINK2	P20155	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	EPHA4	P54764	986 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	IER5	Q5VY09	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms