RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTMR3Q13615 1198 aa8.82□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.82□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NLRP13Q86W25 1043 aa8.82□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR13H1Q8NG92 308 aa8.82□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STOML1Q9UBI4 398 aa8.82□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSC2O15499 205 aa8.81□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPR3P17342 541 aa8.81□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.81□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.81□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.81□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABTB2Q8N961 1025 aa8.81□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRAK1P51617 712 aa8.8□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.8□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MPSTP25325 297 aa8.79□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFIAQ12857 509 aa8.79□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.79□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MUC3BQ9H195 1237 aa8.79□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBSNQ9H1K0 784 aa8.79□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.79□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTMR7Q9Y216 660 aa8.79□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAM11O75078 769 aa8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TXKP42681 527 aa8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACAD11Q709F0 780 aa8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATCAYQ86WG3 371 aa8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DTX1Q86Y01 620 aa8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR152Q8TDT2 470 aa8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMX2A2RU54 273 aa8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPINB4P48594 390 aa8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.77□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF4AO95239 1232 aa8.76□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABL1P00519 1130 aa8.76□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ECM1Q16610 540 aa8.76□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UVSSAQ2YD98 709 aa8.76□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF43Q68DV7 783 aa8.76□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYRFLQ96LU7 910 aa8.76□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.76□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.76□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ICMTO60725 284 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPHA1P21709 976 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC27P30260 824 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP135Q66GS9 1140 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP41Q9BYV8 373 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FSCN2O14926 492 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM13AO94988 1023 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRD1O95696 1058 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HYAL2Q12891 473 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP120Q8N960 986 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EDEM1Q92611 657 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FZD6O60353 706 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDGFAP04085 211 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC25BP30305 580 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCE1DQ5T752 114 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PBX4Q9BYU1 374 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAM19Q9H013 955 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF114Q9Y508 228 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PREPP48147 710 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms