RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489616.1

THUMPD3-AS1-206, THUMPD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene THUMPD3-AS1, Length 583 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DACT2Q5SW24 774 aa20.57■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 INHBEP58166 350 aa20.56■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.56■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SPRYD7Q5W111 196 aa20.56■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FBXW7Q969H0 707 aa20.56■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TRIM17Q9Y577 477 aa20.56■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 BRCA2P51587 3418 aa20.55■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.55■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MYD88Q99836 296 aa20.55■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.55■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SASH1O94885 1247 aa20.54■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PRKG1Q13976 671 aa20.54■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.54■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.53■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MXD3Q9BW11 206 aa20.53■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 COA1Q9GZY4 146 aa20.53■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.53■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 POTEFA5A3E0 1075 aa20.52■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 IFNL1Q8IU54 200 aa20.52■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.52■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ERO1AQ96HE7 468 aa20.52■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CTSWP56202 376 aa20.51■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.51■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RALBP1Q15311 655 aa20.5■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RUNDC1Q96C34 613 aa20.5■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.5■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SPEF2Q9C093 1822 aa20.49■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.49■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MYH3P11055 1940 aa20.49■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.48■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.48■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MBIPQ9NS73 344 aa20.48■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.48■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.48■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.48■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 LAMB1P07942 1786 aa20.47■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 UNCXA6NJT0 531 aa20.47■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MAP3K11Q16584 847 aa20.47■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ARMC5Q96C12 935 aa20.47■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 WNK4Q96J92 1243 aa20.47■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.47■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.47■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.47■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GREM2Q9H772 168 aa20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 EFCC1Q9HA90 598 aa20.46■□□□□ 0.87
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DLGAP5Q15398 846 aa20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.44■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MYO1BO43795 1136 aa20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GTF2IP78347 998 aa20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CRHR2Q13324 411 aa20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FZD1Q9UP38 647 aa20.43■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KCNJ4P48050 445 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SP3Q02447 781 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ARHGEF6Q15052 776 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 IFT57Q9NWB7 429 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.42■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZNF853P0CG23 659 aa20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.41■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GNAI1P63096 354 aa20.4■□□□□ 0.86
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.6 ms