RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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ECHDC1-211ENST00000460558 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa5.76□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 PIK3CDO00329 1044 aa5.76□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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ECHDC1-211ENST00000460558 KCNH2Q12809 1159 aa5.76□□□□□ -1.49
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ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.75□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 SZT2Q5T011 3432 aa5.75□□□□□ -1.49
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ECHDC1-211ENST00000460558 USP17L4A6NCW7 530 aa5.74□□□□□ -1.49
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ECHDC1-211ENST00000460558 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.73□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 NME9Q86XW9 330 aa5.73□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.73□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 RGS22Q8NE09 1264 aa5.73□□□□□ -1.49
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ECHDC1-211ENST00000460558 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 COL6A3P12111 3177 aa5.73□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.73□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 BCORQ6W2J9 1755 aa5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 CARNS1A5YM72 827 aa5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 TM4SF1P30408 202 aa5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 HOXC9P31274 260 aa5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 CTHP32929 405 aa5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 SOGA3Q5TF21 947 aa5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 CST9Q5W186 159 aa5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
ECHDC1-211ENST00000460558 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 TLL1O43897 1013 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 SKIP12755 728 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 COPS2P61201 443 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 USHBP1Q8N6Y0 703 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF4Q96M43 638 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ATG3Q9NT62 314 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.71□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF541Q9H0D2 1346 aa5.71□□□□□ -1.5
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