RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 IDH3AP50213 366 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 SIK1P57059 783 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 ATG3Q9NT62 314 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 SASH3O75995 380 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 ITGB5P18084 799 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 CBLL1Q75N03 491 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 VSIG10LQ86VR7 867 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 DBX1A6NMT0 343 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 WDR64B1ANS9 1081 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 SSFA2P28290 1259 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 KLK14Q9P0G3 267 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 BEND4Q6ZU67 534 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 SEPT3Q9UH03 358 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 PRNPP04156 253 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 SOX18P35713 384 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 DGKZQ13574 1117 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 COX20Q5RI15 118 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 LCE4AQ5TA78 99 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 PODXL2Q9NZ53 605 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 EGFRP00533 1210 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 PKN1Q16512 942 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 DUOXA2Q1HG44 320 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 BCS1LQ9Y276 419 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 J3QW42 95 aa5.59□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 BRD1O95696 1058 aa5.59□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 BMP3P12645 472 aa5.59□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 C16orf46Q6P387 395 aa5.59□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 COL26A1Q96A83 441 aa5.59□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 MYO19Q96H55 970 aa5.59□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC39Q9UFE4 941 aa5.59□□□□□ -1.51
CCDC82-202ENST00000423339 WISP1O95388 367 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 FOSL1P15407 271 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 FAM177BA6PVY3 158 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 MICAL2O94851 1124 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 KCNA1Q09470 495 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 LINC01387J3KSC0 135 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 BIN1O00499 593 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 CDC27P30260 824 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 MSMPQ1L6U9 139 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 FAM26DQ5JW98 314 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 XYLBO75191 536 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 MFSD14AQ96MC6 490 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 TNFRSF10BO14763 440 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 MTMR3Q13615 1198 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 TREML1Q86YW5 311 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 RNF208Q9H0X6 261 aa5.55□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 MMP20O60882 483 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 ABL1P00519 1130 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 FDX2Q6P4F2 183 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 FLCNQ8NFG4 579 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 SPACA7Q96KW9 195 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 ANO2Q9NQ90 1003 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 STIM2Q9P246 746 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 USP20Q9Y2K6 914 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC82-202ENST00000423339 FSCN2O14926 492 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms