RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ABI1Q8IZP0 508 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 KIF4AO95239 1232 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 SLC24A1O60721 1099 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 JAG1P78504 1218 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 SPACA7Q96KW9 195 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 WDR64B1ANS9 1081 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRC-202ENST00000367364 A6NJR5 290 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRC-202ENST00000367364 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
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PTPRC-202ENST00000367364 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRC-202ENST00000367364 ADAM19Q9H013 955 aa9.77□□□□□ -0.85
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PTPRC-202ENST00000367364 PIM2Q9P1W9 311 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 OCLNQ16625 522 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 MSMPQ1L6U9 139 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZMYND15Q9H091 742 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 PTPRAP18433 802 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 CBLL1Q75N03 491 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRC-202ENST00000367364 H3BRJ5 948 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRC-202ENST00000367364 ZAP70P43403 619 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRC-202ENST00000367364 NLRP12P59046 1061 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRC-202ENST00000367364 SGO2Q562F6 1265 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRC-202ENST00000367364 CDCA8Q53HL2 280 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 FDX2Q6P4F2 183 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 GPR152Q8TDT2 470 aa9.7□□□□□ -0.86
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PTPRC-202ENST00000367364 PRNPP04156 253 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 C8AP07357 584 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ACPPP15309 386 aa9.69□□□□□ -0.86
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PTPRC-202ENST00000367364 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.66□□□□□ -0.86
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PTPRC-202ENST00000367364 HHIPQ96QV1 700 aa9.65□□□□□ -0.86
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PTPRC-202ENST00000367364 ELP3Q9H9T3 547 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 SOX13Q9UN79 622 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRC-202ENST00000367364 TIAF1O95411 115 aa9.64□□□□□ -0.87
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