RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CEP135Q66GS9 1140 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 AK2P54819 239 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 TBX22Q9Y458 520 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 CHMLP26374 656 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 HOXC9P31274 260 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 NAPAP54920 295 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 USP37Q86T82 979 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC1P33527 1531 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 SKILP12757 684 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 TRPM2O94759 1503 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf50Q9HD87 102 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 RTL9Q8NET4 1388 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 CBX1P83916 185 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 TFCP2Q12800 502 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 CALRP27797 417 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 KCNA6P17658 529 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 F8W031 263 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 ASIC1P78348 528 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 FERMT2Q96AC1 680 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 PLVAPQ9BX97 442 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.1■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 INCENPQ9NQS7 918 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 BRAPQ7Z569 592 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 HOXB7P09629 217 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 PICALMQ13492 652 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 RTL1A6NKG5 1358 aa23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 APOBRQ0VD83 1088 aa23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 RUFY3Q7L099 469 aa23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D5Q92609 795 aa23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 BICD1Q96G01 975 aa23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.08■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 KRT79Q5XKE5 535 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 DHX58Q96C10 678 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 USP26Q9BXU7 913 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 DYNC1I1O14576 645 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 KRT13P13646 458 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 TYRO3Q06418 890 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.07■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 CHST3Q7LGC8 479 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 CTR9Q6PD62 1173 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 GNA11P29992 359 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 TUBB4AP04350 444 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 ACTN2P35609 894 aa23.06■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC175P0C221 793 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf37Q96NL8 207 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 ATL3Q6DD88 541 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 FSD2A1L4K1 749 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 KRT2P35908 639 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 DNAI1Q9UI46 699 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYM3Q14202 1370 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 EYA2O00167 538 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF790Q6PG37 636 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms