RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365467.1

RNU6-8-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 8, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-8, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-8-201ENST00000365467 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 GPR152Q8TDT2 470 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 FAM135AQ9P2D6 1515 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 MYO5CQ9NQX4 1742 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 XYLBO75191 536 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 PDGFAP04085 211 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 NEFLP07196 543 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 ARAFP10398 606 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 CTBSQ01459 385 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 PCSK7Q16549 785 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 ECM1Q16610 540 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 FAM26DQ5JW98 314 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 GGT6Q6P531 493 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 XKR5Q6UX68 686 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 Q8N3U1 123 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 EDEM1Q92611 657 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 PNMA5Q96PV4 448 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 GSX2Q9BZM3 304 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 STRN4Q9NRL3 753 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 JCADQ9P266 1359 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 A2ML1A8K2U0 1454 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 SYNMO15061 1565 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 CLIP1P30622 1438 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 FAM135BQ49AJ0 1406 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 MLH3Q9UHC1 1453 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 FZD6O60353 706 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 SIN3BO75182 1162 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 MAP3K6O95382 1288 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 NLRP13Q86W25 1043 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 ATCAYQ86WG3 371 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 LRRC7Q96NW7 1537 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-8-201ENST00000365467 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 ADAMTS2O95450 1211 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 SLURP2P0DP57 97 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 ADH6P28332 368 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 IRS1P35568 1242 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 POLIQ9UNA4 740 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 EID1Q9Y6B2 187 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 KDM5CP41229 1560 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 TNRQ92752 1358 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 C2CD2LO14523 706 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 ERCC3P19447 782 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 YY1P25490 414 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 KRT76Q01546 638 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 C8orf34Q49A92 452 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 SYT9Q86SS6 491 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 GJD3Q8N144 294 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 BHMTQ93088 406 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 PMEPA1Q969W9 287 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 SLC30A3Q99726 388 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 CCDC87Q9NVE4 849 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 HCN2Q9UL51 889 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 IQGAP1P46940 1657 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 SASH3O75995 380 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 PSAPP07602 524 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 RARAP10276 462 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 ALAS2P22557 587 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 MAPK1P28482 360 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 SOX18P35713 384 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 CCDC27Q2M243 656 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 TMC1Q8TDI8 760 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 TNFRSF25Q93038 417 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-8-201ENST00000365467 FAM129BQ96TA1 746 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms