Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GJD3Q8N144 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
GJD3Q8N144 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GJD3Q8N144 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GJD3Q8N144 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GJD3Q8N144 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJD3Q8N144 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GJD3Q8N144 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GJD3Q8N144 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GJD3Q8N144 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GJD3Q8N144 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GJD3Q8N144 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GJD3Q8N144 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GJD3Q8N144 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GJD3Q8N144 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GJD3Q8N144 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GJD3Q8N144 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
GJD3Q8N144 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GJD3Q8N144 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GJD3Q8N144 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GJD3Q8N144 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GJD3Q8N144 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GJD3Q8N144 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GJD3Q8N144 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GJD3Q8N144 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GJD3Q8N144 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GJD3Q8N144 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GJD3Q8N144 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
GJD3Q8N144 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GJD3Q8N144 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJD3Q8N144 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GJD3Q8N144 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GJD3Q8N144 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GJD3Q8N144 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GJD3Q8N144 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
GJD3Q8N144 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJD3Q8N144 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
GJD3Q8N144 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJD3Q8N144 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJD3Q8N144 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJD3Q8N144 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJD3Q8N144 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GJD3Q8N144 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJD3Q8N144 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJD3Q8N144 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJD3Q8N144 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJD3Q8N144 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJD3Q8N144 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJD3Q8N144 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD3Q8N144 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GJD3Q8N144 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GJD3Q8N144 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJD3Q8N144 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJD3Q8N144 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJD3Q8N144 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJD3Q8N144 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GJD3Q8N144 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJD3Q8N144 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GJD3Q8N144 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GJD3Q8N144 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJD3Q8N144 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJD3Q8N144 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJD3Q8N144 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD3Q8N144 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GJD3Q8N144 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GJD3Q8N144 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GJD3Q8N144 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GJD3Q8N144 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GJD3Q8N144 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJD3Q8N144 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GJD3Q8N144 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GJD3Q8N144 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GJD3Q8N144 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GJD3Q8N144 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD3Q8N144 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
GJD3Q8N144 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GJD3Q8N144 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GJD3Q8N144 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJD3Q8N144 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD3Q8N144 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD3Q8N144 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJD3Q8N144 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJD3Q8N144 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJD3Q8N144 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GJD3Q8N144 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD3Q8N144 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJD3Q8N144 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GJD3Q8N144 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GJD3Q8N144 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GJD3Q8N144 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GJD3Q8N144 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD3Q8N144 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD3Q8N144 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJD3Q8N144 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD3Q8N144 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD3Q8N144 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD3Q8N144 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJD3Q8N144 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJD3Q8N144 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJD3Q8N144 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms