RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311177.6

HOXB9-201, Transcript of homeobox B9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB9, Length 2,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9-201ENST00000311177 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 ITPK1Q13572 414 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 SCARF1Q14162 830 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 METTL24Q5JXM2 366 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 RPS6KB1P23443 525 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 NUP98P52948 1817 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 CYP21A2P08686 494 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 SYT1P21579 422 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 PI16Q6UXB8 463 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 GJB2P29033 226 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 FBXO3Q9UK99 471 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 KIF3AQ9Y496 699 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 TOM1O60784 492 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 STX6O43752 255 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.257e-10■■■□□ 17.8
HOXB9-201ENST00000311177 FGD1P98174 961 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 USP25Q9UHP3 1055 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 A0A0G2JLW4 131 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 SUSD4Q5VX71 490 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 SLIT2O94813 1529 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXB9-201ENST00000311177 MAST3O60307 1309 aa22.83■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.83■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 PDE8AO60658 829 aa22.83■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.83■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 ZAP70P43403 619 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 STK3Q13188 491 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 C8orf37Q96NL8 207 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 NEK1Q96PY6 1258 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 M0R2C6 588 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 KCNQ4P56696 695 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 BARGINQ6ZT62 677 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 OSBP2Q969R2 916 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 KRT32Q14532 448 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 KIF20AO95235 890 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 CAMTA2O94983 1202 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 ANKRD1Q15327 319 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 WASHC4Q2M389 1173 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 MYH3P11055 1940 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 NGLY1Q96IV0 654 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 ADCY5O95622 1261 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 MCAMP43121 646 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 Q6ZUG5 572 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 SNAP23O00161 211 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 F13A1P00488 732 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 USP48Q86UV5 1035 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 TCHHQ07283 1943 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 MTMR6Q9Y217 621 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB9-201ENST00000311177 IGSF3O75054 1194 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB9-201ENST00000311177 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXB9-201ENST00000311177 PDE8BO95263 885 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB9-201ENST00000311177 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB9-201ENST00000311177 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXB9-201ENST00000311177 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
HOXB9-201ENST00000311177 PHF14O94880 888 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.2 ms