RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col11a1Q61245 1804 aa24.32■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ifi207E9Q3L4 978 aa24.31■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fchsd1Q6PFY1 688 aa24.31■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc38a10Q5I012 1090 aa24.3■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sez6lQ6P1D5 963 aa24.3■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc44a4Q91VA1 707 aa24.3■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col3a1P08121 1464 aa24.3■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ankrd50F7BE84 1390 aa24.29■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Casp1P29452 402 aa24.29■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nbr1P97432 988 aa24.29■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppm1jQ149T7 507 aa24.29■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kansl1lQ5DTI6 991 aa24.28■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc10a5Q5PT54 434 aa24.28■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem143Q8VD26 458 aa24.28■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zbtb3Q91X45 518 aa24.28■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Armc3A2AU72 881 aa24.27■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Map3k13Q1HKZ5 959 aa24.27■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sv2bQ8BG39 683 aa24.27■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sh3bp5Q9Z131 463 aa24.27■■□□□ 1.48
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zscan21Q07231 555 aa24.26■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Osbpl5Q9ER64 874 aa24.26■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adgra2Q91ZV8 1336 aa24.26■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Senp5Q6NXL6 749 aa24.25■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trnp1Q80ZI1 223 aa24.25■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa24.25■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Krt74Q6IFZ9 495 aa24.24■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam155aQ8CCS2 467 aa24.24■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bin2D3Z6Q9 489 aa24.23■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 UncxO08934 530 aa24.23■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zap70P43404 618 aa24.23■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa24.23■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmprss11eQ5S248 423 aa24.23■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wdr70Q3TWF6 657 aa24.22■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 HellsQ60848 821 aa24.22■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dll1Q61483 722 aa24.22■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmc4Q7TQ65 694 aa24.22■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sulf1Q8K007 870 aa24.22■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Btbd19S4R1I0 287 aa24.22■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa24.21■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cbx2P30658 519 aa24.21■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Chl1P70232 1209 aa24.21■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Neurod2Q62414 383 aa24.21■■□□□ 1.47
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa24.2■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myo1bP46735 1107 aa24.2■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Psen2Q61144 448 aa24.2■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam83aQ8K2P2 436 aa24.2■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rasa3Q60790 834 aa24.19■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bend3Q6PAL0 825 aa24.19■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ralgps2Q9ERD6 590 aa24.19■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm8882E9Q7E4 283 aa24.18■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 ArxO35085 564 aa24.18■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vamp4O70480 141 aa24.18■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Specc1Q5SXY1 1067 aa24.18■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 NexnQ7TPW1 607 aa24.18■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ubxn11Q9D572 484 aa24.18■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm6268A2A3U9 297 aa24.17■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hap1O35668 628 aa24.17■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atoh1P48985 351 aa24.17■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Polr3dQ91WD1 398 aa24.17■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ncor1Q60974 2453 aa24.16■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm13128L7MU96 475 aa24.16■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpr182P43142 395 aa24.16■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Npr3P70180 536 aa24.16■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spata18Q0P557 537 aa24.16■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 CrbnQ8C7D2 445 aa24.16■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Amer2Q8CCJ4 672 aa24.16■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Il31raQ8K5B1 716 aa24.16■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aifm3Q3TY86 605 aa24.15■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gnat3Q3V3I2 354 aa24.15■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Jarid2Q62315 1234 aa24.15■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa24.14■■□□□ 1.46
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 GabrdP22933 449 aa24.14■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gjb1P28230 283 aa24.14■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 VgfQ0VGU4 617 aa24.14■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rhbdl3P58873 404 aa24.13■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fads2p1Q0VAX3 487 aa24.13■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrc24Q8BHA1 521 aa24.13■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smc4Q8CG47 1286 aa24.13■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nudt12Q9DCN1 462 aa24.13■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plekho1Q9JIY0 408 aa24.13■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Btn2a2A4QPC6 514 aa24.12■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Phldb3E9QAF4 648 aa24.12■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Grm8P47743 908 aa24.12■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Irx3P81067 507 aa24.12■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klrg2Q3UM83 387 aa24.12■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc148Q6P5U8 527 aa24.12■■□□□ 1.45
Ltb-201ENSMUST00000025262 Apbb1Q9QXJ1 710 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 87.2 ms