Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
Arid4aF8VPQ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Arid4aF8VPQ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Arid4aF8VPQ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Arid4aF8VPQ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
Arid4aF8VPQ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Arid4aF8VPQ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Arid4aF8VPQ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Arid4aF8VPQ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Arid4aF8VPQ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Arid4aF8VPQ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Arid4aF8VPQ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Arid4aF8VPQ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Arid4aF8VPQ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Arid4aF8VPQ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Arid4aF8VPQ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Arid4aF8VPQ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
Arid4aF8VPQ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Arid4aF8VPQ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Arid4aF8VPQ2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Arid4aF8VPQ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Arid4aF8VPQ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Arid4aF8VPQ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Arid4aF8VPQ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Arid4aF8VPQ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Arid4aF8VPQ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Arid4aF8VPQ2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Arid4aF8VPQ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Arid4aF8VPQ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Arid4aF8VPQ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Arid4aF8VPQ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Arid4aF8VPQ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Arid4aF8VPQ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Arid4aF8VPQ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Arid4aF8VPQ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Arid4aF8VPQ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.95■■■■□ 3.34
Arid4aF8VPQ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Arid4aF8VPQ2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Arid4aF8VPQ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Arid4aF8VPQ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Arid4aF8VPQ2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Arid4aF8VPQ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Arid4aF8VPQ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Arid4aF8VPQ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Arid4aF8VPQ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Arid4aF8VPQ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Arid4aF8VPQ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Arid4aF8VPQ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Arid4aF8VPQ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Arid4aF8VPQ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Arid4aF8VPQ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Arid4aF8VPQ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Arid4aF8VPQ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Arid4aF8VPQ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Arid4aF8VPQ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Arid4aF8VPQ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Arid4aF8VPQ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Arid4aF8VPQ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Arid4aF8VPQ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Arid4aF8VPQ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Arid4aF8VPQ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Arid4aF8VPQ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Arid4aF8VPQ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Arid4aF8VPQ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Arid4aF8VPQ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Arid4aF8VPQ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Arid4aF8VPQ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Arid4aF8VPQ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Arid4aF8VPQ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Arid4aF8VPQ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Arid4aF8VPQ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Arid4aF8VPQ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Arid4aF8VPQ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Arid4aF8VPQ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Arid4aF8VPQ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Arid4aF8VPQ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Arid4aF8VPQ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Arid4aF8VPQ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Arid4aF8VPQ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Arid4aF8VPQ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Arid4aF8VPQ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Arid4aF8VPQ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Arid4aF8VPQ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Arid4aF8VPQ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Arid4aF8VPQ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Arid4aF8VPQ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Arid4aF8VPQ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Arid4aF8VPQ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Arid4aF8VPQ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Arid4aF8VPQ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Arid4aF8VPQ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Arid4aF8VPQ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Arid4aF8VPQ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Arid4aF8VPQ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Arid4aF8VPQ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Arid4aF8VPQ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Arid4aF8VPQ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Arid4aF8VPQ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms