Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.42■■■■■ 5.02
Psen2Q61144 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Psen2Q61144 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Psen2Q61144 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Psen2Q61144 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Psen2Q61144 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
Psen2Q61144 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Psen2Q61144 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Psen2Q61144 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Psen2Q61144 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Psen2Q61144 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Psen2Q61144 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Psen2Q61144 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Psen2Q61144 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Psen2Q61144 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Psen2Q61144 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Psen2Q61144 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Psen2Q61144 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Psen2Q61144 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Psen2Q61144 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Psen2Q61144 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Psen2Q61144 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Psen2Q61144 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Psen2Q61144 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Psen2Q61144 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Psen2Q61144 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Psen2Q61144 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Psen2Q61144 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Psen2Q61144 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Psen2Q61144 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Psen2Q61144 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Psen2Q61144 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Psen2Q61144 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Psen2Q61144 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Psen2Q61144 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Psen2Q61144 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Psen2Q61144 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Psen2Q61144 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Psen2Q61144 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Psen2Q61144 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Psen2Q61144 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Psen2Q61144 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Psen2Q61144 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Psen2Q61144 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Psen2Q61144 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Psen2Q61144 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Psen2Q61144 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Psen2Q61144 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Psen2Q61144 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Psen2Q61144 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Psen2Q61144 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Psen2Q61144 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Psen2Q61144 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Psen2Q61144 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Psen2Q61144 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Psen2Q61144 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Psen2Q61144 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Psen2Q61144 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Psen2Q61144 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Psen2Q61144 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Psen2Q61144 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Psen2Q61144 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Psen2Q61144 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Psen2Q61144 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Psen2Q61144 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Psen2Q61144 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Psen2Q61144 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Psen2Q61144 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Psen2Q61144 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Psen2Q61144 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Psen2Q61144 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Psen2Q61144 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Psen2Q61144 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Psen2Q61144 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Psen2Q61144 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Psen2Q61144 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Psen2Q61144 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Psen2Q61144 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Psen2Q61144 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Psen2Q61144 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Psen2Q61144 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Psen2Q61144 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Psen2Q61144 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Psen2Q61144 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Psen2Q61144 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Psen2Q61144 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Psen2Q61144 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Psen2Q61144 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Psen2Q61144 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Psen2Q61144 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Psen2Q61144 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Psen2Q61144 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Psen2Q61144 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Psen2Q61144 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Psen2Q61144 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Psen2Q61144 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Psen2Q61144 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Psen2Q61144 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Psen2Q61144 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Psen2Q61144 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 662.8 ms