RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Popdc2Q9ES82 367 aa23.44■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa23.43■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sik3Q6P4S6 1311 aa23.43■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Npy5rO70342 466 aa23.43■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Babam1Q3UI43 333 aa23.43■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Col3a1P08121 1464 aa23.42■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SlkO54988 1233 aa23.42■■□□□ 1.34
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Me3Q8BMF3 604 aa23.42■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc39a11Q8BWY7 342 aa23.42■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp113Q8C689 439 aa23.42■■□□□ 1.34
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cep57l1Q8VDS7 400 aa23.42■■□□□ 1.34
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kiaa0753Q6A000 959 aa23.42■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc66Q6NS45 935 aa23.42■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Iffo2Q8R2V2 512 aa23.42■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa23.42■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pla2g4fQ50L41 855 aa23.41■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Leo1Q5XJE5 667 aa23.41■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gimap8Q75N62 688 aa23.41■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa23.41■■□□□ 1.34
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mroh6V9GX81 722 aa23.4■■□□□ 1.34
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif4P33174 1231 aa23.39■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa23.39■■□□□ 1.34
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scn11aQ9R053 1765 aa23.39■■□□□ 1.33
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pram1Q6BCL1 675 aa23.39■■□□□ 1.33
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ZwintQ9CQU5 252 aa23.39■■□□□ 1.33
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm29094F6Q785 221 aa23.38■■□□□ 1.33
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ubap1lG3UW59 384 aa23.38■■□□□ 1.33
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif20aP97329 887 aa23.38■■□□□ 1.33
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxo41Q6NS60 873 aa23.38■■□□□ 1.33
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sytl4Q9R0Q1 673 aa23.37■■□□□ 1.33
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arhgap33Q80YF9 1305 aa23.37■■□□□ 1.33
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd22P35329 862 aa23.36■■□□□ 1.33
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppfia3P60469 1194 aa23.34■■□□□ 1.33
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 IcoslgQ9JHJ8 322 aa23.33■■□□□ 1.33
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Casp1P29452 402 aa23.32■■□□□ 1.32
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Washc4Q3UMB9 1173 aa23.32■■□□□ 1.32
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ube3cQ80U95 1083 aa23.32■■□□□ 1.32
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igbp1bQ9QZ29 343 aa23.32■■□□□ 1.32
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