RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 NXPH4O95158 308 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 CATP04040 527 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 P04436 131 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 SERPIND1P05546 499 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 HSD17B1P14061 328 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 PSMB5P28074 263 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 HSD17B2P37059 387 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 OPRL1P41146 370 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 SLC1A1P43005 524 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 SSR4P51571 173 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 PHEXP78562 749 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 ARL16Q0P5N6 197 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 RAB40BQ12829 278 aa4.5□□□□□ -1.69
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CCL20-201ENST00000358813 POU6F1Q14863 301 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 LINC00523Q86TU6 105 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 ZNF567Q8N184 647 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 MDS2Q8NDY4 140 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 NUP37Q8NFH4 326 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 OR2L3Q8NG85 312 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 OR51Q1Q8NH59 317 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 TM4SF19Q96DZ7 209 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
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CCL20-201ENST00000358813 CYTH2Q99418 400 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 CCL19Q99731 98 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 NRTNQ99748 197 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 SLITRK2Q9H156 845 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 LIME1Q9H400 295 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 EHD1Q9H4M9 534 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 TAC3Q9UHF0 121 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 MGAT4AQ9UM21 535 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 L3MBTL1Q9Y468 752 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 FBN3Q75N90 2809 aa4.5□□□□□ -1.69
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CCL20-201ENST00000358813 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 EFNA3P52797 238 aa4.49□□□□□ -1.69
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CCL20-201ENST00000358813 MMP28Q9H239 520 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 IKZF5Q9H5V7 419 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 ADGRL4Q9HBW9 690 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-201ENST00000358813 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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