RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM74A3Q4VXF1 159 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 PYCR3Q53H96 274 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 C12orf60Q5U649 245 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELP2Q6IA86 826 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNIH2Q6PI25 160 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZQT7 251 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 MOB3BQ86TA1 216 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4D6Q8NGJ1 314 aa-2.52□□□□□ -2.81
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ERVK-8P63133 956 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRPSAP1Q14558 356 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 C9orf135Q5VTT2 229 aa-2.53□□□□□ -2.81
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CPNE9Q8IYJ1 553 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 HS3ST5Q8IZT8 346 aa-2.53□□□□□ -2.81
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SCFD1Q8WVM8 642 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNASE1L2Q92874 299 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMBIM1Q969X1 311 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATA13Q96N96 652 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 PANX3Q96QZ0 392 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GLI3P10071 1580 aa-2.53□□□□□ -2.82
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CDH16O75309 829 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOM1L1O75674 476 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANXA3P12429 323 aa-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CFHR2P36980 270 aa-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CDK16Q00536 496 aa-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC158Q5M9N0 1113 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM3DQ96BQ1 224 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEH1LQ96EE3 360 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEC22AQ96IW7 307 aa-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-871P-201ENST00000516122 AMELYQ99218 206 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR22Q99680 433 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR76Q9H967 626 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM161AQ9NX61 479 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANAPC7Q9UJX3 599 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 PKHD1P08F94 4074 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0B4J2C4 111 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 GABRR3A8MPY1 467 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERLIN2O94905 339 aa-2.55□□□□□ -2.82
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