RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	YKL222C	P35995	705 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	RPP1	P38786	293 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	CKB2	P38930	258 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	HCM1	P25364	564 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	NGG1	P32494	702 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	PHO23	P50947	330 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	DCS2	Q12123	353 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	YCR015C	P25616	317 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	MNN4	P36044	1178 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	GIP4	P39732	760 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	RET2	P43621	546 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	NRG1	Q03125	231 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	NTO1	Q12311	748 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	FKH2	P41813	862 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	ORC4	P54791	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	YBR259W	P38338	688 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	TDA3	P38758	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	ECM1	P39715	212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	YGR153W	P48238	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	YBP2	P53169	641 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	HFD1	Q04458	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	TGL5	Q12043	749 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	TRM13	Q12383	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG34	YOL083W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	GID8	P40208	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	YHR112C	P38716	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	ELO3	P40319	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	ECM9	Q02202	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	MCM21	Q06675	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	MET3	P08536	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	MAL31	P38156	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	APN2	P38207	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	YBR053C	P38235	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	BEM4	P39011	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	MUP1	P50276	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	DLT1	Q04216	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	GAD1	Q04792	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	TMA17	Q12513	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	ERG4	P25340	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	TRM2	P33753	639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	APT2	P36973	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	PAF1	P38351	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	HXT7	P39004	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	KIN4	Q01919	800 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	AIM39	Q08223	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	EUG1	P32474	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	KTR4	P38131	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	YHR202W	P38887	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	HOS4	P40480	1083 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	AIM21	P40563	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	YIR042C	P40586	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	YJR120W	P47157	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	SWI6	P09959	803 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	OAF3	P36023	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	YKR075C	P36155	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	AMA1	P50082	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	REC102	Q02721	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG34	YOL083W	APM4	Q99186	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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