RNA–Protein interactions for RNA: YHR117W

TOM71, Transcript of Mitochondrial outer membrane protein, yeastyeast

Gene TOM71, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM71YHR117W YMR262WP38430 313 aa8.31□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W KAP114P53067 1004 aa8.31□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W RCM1P53972 490 aa8.31□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W ATG13Q06628 738 aa8.31□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W SDH5Q08230 162 aa8.31□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W DAS2Q12084 232 aa8.31□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W DBP3P20447 523 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W TRX1P22217 103 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W SWC5P38326 303 aa8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W UTP9P38882 575 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W BIM1P40013 344 aa8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W JEM1P40358 645 aa8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W ABM1P47146 123 aa8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W SRL4Q03085 281 aa8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W DXO1Q06349 442 aa8.3□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W RAP1P11938 827 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W ATE1P16639 503 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W REC107P21651 314 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W PRP19P32523 503 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W MUD2P36084 527 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W SCS2P40075 244 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W TOK1P40310 691 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W HAT1Q12341 374 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W TRP2P00899 507 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W GCN3P14741 305 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W URA4P20051 364 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W IME1P21190 360 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W ADE2P21264 571 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W KRE2P27809 442 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W ZIP1P31111 875 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W MNN11P46985 422 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W HPC2Q01448 625 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W FCP1Q03254 732 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W SAS4Q04003 481 aa8.29□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W STE3P06783 470 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W PIF1P07271 859 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W SDS22P36047 338 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W SMF2P38778 549 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W TED1P40533 473 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W MKT1P40850 830 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W YJR054WP47114 497 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W YNL146WP53906 100 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W KAP120Q02932 1032 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W VIK1Q12045 647 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W TIP41Q12199 356 aa8.28□□□□□ -1.08
TOM71YHR117W YBL010CP32788 280 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W PEX32P38292 413 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W EMP65P40085 556 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W PCL7P40186 285 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W GPD2P41911 440 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W MAD3P47074 515 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W LSB1P53281 241 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W YDR090CQ03193 310 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W PPM1Q04081 328 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W LAP2Q10740 671 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W YOR131CQ12486 218 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W LAM4P38800 1345 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W STF1P01098 86 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W SNF1P06782 633 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W LAT1P12695 482 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W MSD1P15179 658 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data8.27□□□□□ -1.09not detected
TOM71YHR117W PPQ1P32945 549 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W SDH8P38345 138 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W VPS8P39702 1274 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W YIL077CP40508 320 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W LYS14P40971 790 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W COX16P47081 118 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W TEL2P53038 688 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W GTR1Q00582 310 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W CMC2Q3E7A4 109 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W YOS9Q99220 542 aa8.27□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W SES1P07284 462 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W TRL1P09880 827 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W TIF1P10081 395 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W RAD4P14736 754 aa8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W RVS161P25343 265 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W TFB1P32776 642 aa8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W VPS21P36017 210 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W NOP4P37838 685 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W EPL1P43572 832 aa8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W RBG2P53295 368 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W RSC4Q02206 625 aa8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W TFB2Q02939 513 aa8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W ARP10Q04549 284 aa8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W UIP4Q08926 304 aa8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W APC11Q12157 165 aa8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W OCA6Q12454 224 aa8.26□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W IPP1P00817 287 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TOM71YHR117W PRI1P10363 409 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 109.7 ms