RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data5.39□□□□□ -1.55not detected
CYK3YDL117W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ARG1P22768 420 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MUD2P36084 527 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W FES1P38260 290 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SWC5P38326 303 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SCS2P40075 244 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TEL2P53038 688 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SPC105P53148 917 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W LIF1P53150 421 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W GOR1P53839 350 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RCM1P53972 490 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ATG16Q03818 150 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PPM1Q04081 328 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W APC11Q12157 165 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PHM7Q12252 991 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TUS1Q06412 1307 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YMR085WP0CF18 432 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TYS1P36421 394 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W LSM12P38828 187 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W NOP16P40007 231 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SNL1P40548 159 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YJR039WP47107 1121 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PEX8P53248 589 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W USA1Q03714 838 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W VPS64Q03944 604 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SFH1Q06168 426 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W DXO1Q06349 442 aa5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W KIN3P22209 435 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PUP1P25043 261 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W DID4P36108 232 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SDH8P38345 138 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YAP1801P38856 637 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MNN11P46985 422 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W NPA3P47122 385 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MRPL50P53724 139 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W CWC25P53854 179 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W NIS1P53939 407 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TFB2Q02939 513 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ARP6Q12509 438 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SEY1Q99287 776 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SIR3P06701 978 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W DBP3P20447 523 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W KRE2P27809 442 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YPT52P36018 234 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data5.38□□□□□ -1.55not detected
CYK3YDL117W KAP104P38217 918 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W POP2P39008 433 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SPO22P40511 975 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W POL31P46957 487 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W FOL2P51601 243 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W FOL1P53848 824 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SIW14P53965 281 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ERO1Q03103 563 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RBA50Q04418 439 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SPC24Q04477 213 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W IVY1Q04934 453 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W COA4Q05809 96 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YLR031WQ07978 186 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YOR223WQ12015 292 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W GYP5Q12344 894 aa5.38□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TRP2P00899 507 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RAD53P22216 821 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W DAK2P43550 591 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YJL055WP47044 245 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RET3P53600 189 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data5.37□□□□□ -1.55not detected
CYK3YDL117W SPC2Q04969 178 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SEC10Q06245 871 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PGC1Q08959 321 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W NCR1Q12200 1170 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W STE3P06783 470 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SUP45P12385 437 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ADE2P21264 571 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PRP19P32523 503 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SRB4P32569 687 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W DOA4P32571 926 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MTC2P34246 357 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W POP7P38291 140 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W YIL077CP40508 320 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W MKT1P40850 830 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W RMI1Q02685 241 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W DAS2Q12084 232 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W OCA6Q12454 224 aa5.37□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W INH1P01097 85 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W ATP4P05626 244 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data5.36□□□□□ -1.55not detected
CYK3YDL117W URA4P20051 364 aa5.36□□□□□ -1.55
CYK3YDL117W HXT3P32466 567 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30 ms