RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.09	□□□□□ -1.59
VAR1	Q0140	YBR284W	P38150	797 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	ALR2	P43553	858 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	ENV7	Q12003	364 aa		5.08	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	EAF1	Q06337	982 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	MLH3	Q12083	715 aa		5.07	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	MBR1	P23493	339 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	PET10	P36139	283 aa		5.06	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	SSY5	P47002	699 aa		5.05	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	FMP25	Q08023	583 aa		5.05	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	YOR022C	Q12204	715 aa		5.05	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	SIC1	P38634	284 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	NIT3	P49954	291 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	ATG4	P53867	494 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	SFB3	P38810	929 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VAR1	Q0140	PRC1	P00729	532 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	DAL7	P21826	554 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	UBX5	Q06682	500 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	TAX4	P47030	604 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	RSC3	Q06639	885 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	SPO75	Q07798	868 aa		5	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	TOP3	P13099	656 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	YCL002C	P25565	263 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	MAF1	P41910	395 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	TAD1	P53065	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	ERP6	P53198	216 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	GPR1	Q12361	961 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	EMC3	P36039	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	SAP190	P36123	1033 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	FHN1	P53279	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	THI21	Q08975	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	YBR259W	P38338	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAR1	Q0140	ARE1	P25628	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	PHO11	P35842	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	PHO12	P38693	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	STE12	P13574	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	GYP8	P43570	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	YMC1	P32331	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	HFD1	Q04458	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	GAD1	Q04792	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	REH1	Q06709	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	FUB1	P25659	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	FMO1	P38866	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	OSH2	Q12451	1283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	MTL1	P53214	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	ECM1	P39715	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	ZIP2	P53061	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	YDR514C	Q04408	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	Q0140	GMH1	P36125	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	SHR5	P41912	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	LYS9	P38999	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	CIT1	P00890	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	HOT13	P36078	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	YBP2	P53169	641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	USV1	Q12132	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	DIF1	O13577	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	RAD4	P14736	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	HUL4	P40985	892 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	ALG2	P43636	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	ATP25	Q03153	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	TAF8	Q03750	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	Q0140	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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