RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616558.4

SYTL1-210, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-210ENST00000616558 XAGE2Q96GT9 111 aa23.56■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 BECN1Q14457 450 aa23.55■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 KIF2CQ99661 725 aa23.55■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 LRP5O75197 1615 aa23.55■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 SSFA2P28290 1259 aa23.54■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 NFIXQ14938 502 aa23.54■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 COL4A1P02462 1669 aa23.54■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 PLSCR1O15162 318 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 HAUS7Q99871 368 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 SGSM2O43147 1006 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 RTL9Q8NET4 1388 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 PDE8BO95263 885 aa23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYTL1-210ENST00000616558 TAF5LO75529 589 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 GYS1P13807 737 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 NLRP3Q96P20 1036 aa23.51■■□□□ 1.35
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SYTL1-210ENST00000616558 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 GOLIM4O00461 696 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 ZNF827Q17R98 1081 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 FAM227BQ96M60 508 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 SNAP23O00161 211 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 SNRKQ9NRH2 765 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 HIP1O00291 1037 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
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SYTL1-210ENST00000616558 CNBD1Q8NA66 436 aa23.48■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 MCCP23508 829 aa23.47■■□□□ 1.35
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SYTL1-210ENST00000616558 CHGBP05060 677 aa23.47■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 CHRNDQ07001 517 aa23.47■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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SYTL1-210ENST00000616558 HSCBQ8IWL3 235 aa23.46■■□□□ 1.35
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SYTL1-210ENST00000616558 AKT1S1Q96B36 256 aa23.45■■□□□ 1.35
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SYTL1-210ENST00000616558 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.45■■□□□ 1.35
SYTL1-210ENST00000616558 SLC5A1P13866 664 aa23.45■■□□□ 1.34
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SYTL1-210ENST00000616558 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.45■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 PALD1Q9ULE6 856 aa23.45■■□□□ 1.34
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SYTL1-210ENST00000616558 SERPINB2P05120 415 aa23.43■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.43■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 RAD50Q92878 1312 aa23.43■■□□□ 1.34
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SYTL1-210ENST00000616558 ZAP70P43403 619 aa23.43■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 PHKA1P46020 1223 aa23.43■■□□□ 1.34
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SYTL1-210ENST00000616558 RABEP1Q15276 862 aa23.43■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 TM4SF1P30408 202 aa23.42■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.42■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC102BQ68D86 513 aa23.42■■□□□ 1.34
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SYTL1-210ENST00000616558 A0A1B0GUL6 1792 aa23.41■■□□□ 1.34
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SYTL1-210ENST00000616558 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 DDR1Q08345 913 aa23.41■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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SYTL1-210ENST00000616558 ST5P78524 1137 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 SNX21Q969T3 373 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.39■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.39■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 HSPA4P34932 840 aa23.39■■□□□ 1.34
SYTL1-210ENST00000616558 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.39■■□□□ 1.33
SYTL1-210ENST00000616558 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SYTL1-210ENST00000616558 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SYTL1-210ENST00000616558 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.38■■□□□ 1.33
SYTL1-210ENST00000616558 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SYTL1-210ENST00000616558 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SYTL1-210ENST00000616558 KCNJ4P48050 445 aa23.38■■□□□ 1.33
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