RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP34.43■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 RTL9Q8NET4 1388 aa34.43■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1B0GUL7 405 aa34.42■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 TIMM10P62072 90 aa34.42■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 FLAD1Q8NFF5 587 aa34.42■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 HSPA4P34932 840 aa34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 NEUROD6Q96NK8 337 aa34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 NARFQ9UHQ1 456 aa34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBR3Q6ZT12 1888 aa34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 RIC1Q4ADV7 1423 aa34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 FSD1Q9BTV5 496 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPEF2Q9C093 1822 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 RFC4P35249 363 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 VGLL2Q8N8G2 317 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCL2L12Q9HB09 334 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCC12Q96J65 1359 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 ST18O60284 1047 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 PALD1Q9ULE6 856 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 CNNM1Q9NRU3 951 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZPR1O75312 459 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC152Q4G0S7 254 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 METTL24Q5JXM2 366 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 KBTBD3Q8NAB2 608 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 XAGE2Q96GT9 111 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM227BQ96M60 508 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 COL24A1Q17RW2 1714 aa34.32■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 MED23Q9ULK4 1368 aa34.32■■■■□ 3.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 DDIT3P35638 169 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 MROH5Q6ZUA9 1318 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC158Q5M9N0 1113 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNB2Q92953 911 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM177BA6PVY3 158 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP2B3Q16720 1220 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC10A5Q5PT55 438 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 QSER1Q2KHR3 1735 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC171Q6TFL3 1326 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A0D9SFI3 127 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDE8BO95263 885 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 USPL1Q5W0Q7 1092 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAG1Q9NWQ8 432 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D9BQ66K14 1250 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 C4AP0C0L4 1744 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 MCM2P49736 904 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTH1RQ03431 593 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP4K1Q92918 833 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADORA1P30542 326 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 NYXQ9GZU5 481 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHMP5Q9NZZ3 219 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARAP2Q8WZ64 1704 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 GORABQ5T7V8 394 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNX14Q9Y5W7 946 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 NEK4P51957 841 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 NECTIN1Q15223 517 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 ERFEQ4G0M1 354 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTC39AQ5SRH9 613 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 GYS1P13807 737 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGFR2P21802 821 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEC31BQ9NQW1 1179 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 GOLIM4O00461 696 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 SETDB2Q96T68 719 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 NBR1Q14596 966 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 NFKBIBQ15653 356 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 MPHOSPH8Q99549 860 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC16A10Q8TF71 515 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 LPIN2Q92539 896 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 RASEFQ8IZ41 740 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 CASZ1Q86V15 1759 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 HELLSQ9NRZ9 838 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAF5LO75529 589 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSL1Q68DK7 614 aa34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 TM6SF1Q9BZW5 370 aa34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178.2 ms