RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.83□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 C6orf229H3BNL8 230 aa14.83□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 PPP2R1AP30153 589 aa14.83□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 TCIRG1Q13488 830 aa14.83□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 COPS6Q7L5N1 327 aa14.83□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 TMC4Q7Z404 712 aa14.83□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 SCN9AQ15858 1988 aa14.83□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 POTEFA5A3E0 1075 aa14.82□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.82□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.82□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.82□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 FKBP1BP68106 108 aa14.81□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 GMLQ99445 158 aa14.81□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.81□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.81□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 BRCA2P51587 3418 aa14.8□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.8□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 FAM89AQ96GI7 184 aa14.79□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.79□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 FKTNO75072 461 aa14.78□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.78□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 NECTIN2Q92692 538 aa14.78□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.78□□□□□ -0.04
RNF4-218ENST00000513284 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 NFE2L2Q16236 605 aa14.77□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.77□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 EYA3Q99504 573 aa14.77□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.77□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.77□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 SZT2Q5T011 3432 aa14.77□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.76□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.76□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.76□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 ZNF609O15014 1411 aa14.75□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.75□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.74□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 USP17L8P0C7I0 530 aa14.74□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 CAP1Q01518 475 aa14.74□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.74□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.74□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 KRT24Q2M2I5 525 aa14.73□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.73□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 UFL1O94874 794 aa14.72□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 MXD3Q9BW11 206 aa14.72□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 TRIM17Q9Y577 477 aa14.72□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 WNT10BO00744 389 aa14.71□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 SPRYD7Q5W111 196 aa14.71□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.71□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.71□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 FZD1Q9UP38 647 aa14.71□□□□□ -0.05
RNF4-218ENST00000513284 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
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RNF4-218ENST00000513284 USP17L4A6NCW7 530 aa14.7□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 SREBF2Q12772 1141 aa14.7□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 PRKG1Q13976 671 aa14.7□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.7□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 GGA1Q9UJY5 639 aa14.7□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.7□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 PSME4Q14997 1843 aa14.69□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 G3V3G9 751 aa14.69□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.69□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 IFNL1Q8IU54 200 aa14.69□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 ARMC5Q96C12 935 aa14.69□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.69□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.69□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.69□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
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RNF4-218ENST00000513284 PODNQ7Z5L7 613 aa14.68□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 OTUD5Q96G74 571 aa14.68□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 A0A0C4DFX4 3053 aa14.67□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 NEFMP07197 916 aa14.67□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 ALDH1A1P00352 501 aa14.66□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 RIPK4P57078 832 aa14.66□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 INHBEP58166 350 aa14.66□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.66□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.66□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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