RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 ADORA1P30542 326 aa20.93■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 TXNRD1Q16881 649 aa20.93■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 FBXO3Q9UK99 471 aa20.93■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF609O15014 1411 aa20.92■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 APBA3O96018 575 aa20.92■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 SCN7AQ01118 1682 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 XAGE2Q96GT9 111 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 FSD1Q9BTV5 496 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 DDIT3P35638 169 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.89■□□□□ 0.94
PRRT4-205ENST00000489835 SNAP23O00161 211 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 SGSM2O43147 1006 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 CHGBP05060 677 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 MRE11P49959 708 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 GORABQ5T7V8 394 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 FAM227BQ96M60 508 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 ABCC12Q96J65 1359 aa20.88■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 C4AP0C0L4 1744 aa20.88■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 TAF5LO75529 589 aa20.88■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 ATP2B3Q16720 1220 aa20.88■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 HAUS7Q99871 368 aa20.88■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.87■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 NPHP1O15259 732 aa20.87■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 PDE8BO95263 885 aa20.87■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 NFIXQ14938 502 aa20.87■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 FBXO41Q8TF61 875 aa20.87■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 GOLIM4O00461 696 aa20.86■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.86■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 NYXQ9GZU5 481 aa20.86■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 SNRKQ9NRH2 765 aa20.86■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 TAF1P21675 1872 aa20.86■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 COL4A1P02462 1669 aa20.86■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 RGL2O15211 777 aa20.86■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.85■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.85■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.85■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.85■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 PALD1Q9ULE6 856 aa20.85■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.85■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 A0A0D9SFI3 127 aa20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 ADRA2BP18089 450 aa20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 SCARF1Q14162 830 aa20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.84■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 SPEF2Q9C093 1822 aa20.83■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 GYS1P13807 737 aa20.83■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 CLCN1P35523 988 aa20.83■□□□□ 0.93
PRRT4-205ENST00000489835 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.83■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 PTH1RQ03431 593 aa20.83■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF827Q17R98 1081 aa20.83■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 PI16Q6UXB8 463 aa20.83■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.83■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 NLRP3Q96P20 1036 aa20.83■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 PLSCR1O15162 318 aa20.82■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 GBP4Q96PP9 640 aa20.82■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.82■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 LAMB2P55268 1798 aa20.82■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 SSFA2P28290 1259 aa20.82■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.81■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 RTL9Q8NET4 1388 aa20.81■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 HIP1O00291 1037 aa20.81■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 CHRNDQ07001 517 aa20.81■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.8■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.8■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 FGFR2P21802 821 aa20.79■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 MCCP23508 829 aa20.79■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 ZAP70P43403 619 aa20.79■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 CASZ1Q86V15 1759 aa20.79■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.79■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 PTMSP20962 102 aa20.79■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 PHKA1P46020 1223 aa20.79■□□□□ 0.92
PRRT4-205ENST00000489835 RABEP1Q15276 862 aa20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms