RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CSF1R	P07333	972 aa		21.98	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		21.97	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	YDJC	A8MPS7	323 aa		21.97	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP2B4	P23634	1241 aa		21.97	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		21.97	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	21.96	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	BEND3	Q5T5X7	828 aa		21.96	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	IFFO2	Q5TF58	517 aa		21.96	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		21.96	■■□□□ 1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH1L1	O75891	902 aa		21.95	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		21.95	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424		H7C1D1	291 aa		21.94	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD17	O75943	681 aa		21.94	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	UFL1	O94874	794 aa		21.94	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PODN	Q7Z5L7	613 aa		21.94	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	GREM2	Q9H772	168 aa		21.94	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF609	O15014	1411 aa		21.94	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	LTBP1	Q14766	1721 aa		21.94	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ECE2	O60344	883 aa		21.93	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	21.93	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP14	P50281	582 aa		21.93	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	21.93	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	21.93	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	21.93	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	21.93	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		21.93	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		21.93	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	21.92	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		21.92	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTNAP1	P78357	1384 aa		21.91	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMD14	O00487	310 aa		21.91	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	RIMBP2	O15034	1052 aa		21.91	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SLFN5	Q08AF3	891 aa		21.91	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		21.91	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		21.91	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRC	P08575	1304 aa		21.9	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	RASSF10	A6NK89	507 aa		21.9	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424		G3V3G9	751 aa		21.9	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGA6	P23229	1130 aa		21.9	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		21.9	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MED23	Q9ULK4	1368 aa		21.89	■■□□□ 1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		21.89	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	21.89	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		21.89	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GRM8	O00222	908 aa		21.88	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		21.88	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		21.88	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	COL4A1	P02462	1669 aa		21.88	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		21.87	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424		F6X3S4	739 aa		21.87	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXO4	P98177	505 aa		21.87	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	DOK7	Q18PE1	504 aa		21.87	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MICALL2	Q8IY33	904 aa		21.87	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	UTY	O14607	1347 aa		21.86	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	21.86	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	21.86	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	21.86	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	21.86	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	COA1	Q9GZY4	146 aa		21.86	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	21.86	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		21.86	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	PCNT	O95613	3336 aa		21.85	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	21.85	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		21.85	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		21.85	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L3	A6NCW0	530 aa		21.84	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L4	A6NCW7	530 aa		21.84	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	21.84	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM161A	Q3B820	660 aa		21.84	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	21.84	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		21.84	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GML	Q99445	158 aa		21.84	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	21.84	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		21.83	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH3	P11055	1940 aa		21.83	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		21.83	■■□□□ 1.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		21.82	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		21.82	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	21.82	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		21.82	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		21.82	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ECE1	P42892	770 aa		21.81	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CST9	Q5W186	159 aa		21.81	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		21.81	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		21.81	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	21.8	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	VEGFB	P49765	207 aa		21.8	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRND	Q07001	517 aa		21.8	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		21.8	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		21.8	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SPEF2	Q9C093	1822 aa		21.8	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L8	P0C7I0	530 aa		21.79	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	21.79	■■□□□ 1.08

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