RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 TMX3Q96JJ7 454 aa27.41■■□□□ 1.98
VSTM4-201ENST00000298454 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.41■■□□□ 1.98
VSTM4-201ENST00000298454 GNPATO15228 680 aa27.4■■□□□ 1.98
VSTM4-201ENST00000298454 RPS6KA4O75676 772 aa27.4■■□□□ 1.98
VSTM4-201ENST00000298454 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
VSTM4-201ENST00000298454 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
VSTM4-201ENST00000298454 KCNB2Q92953 911 aa27.39■■□□□ 1.98
VSTM4-201ENST00000298454 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ4P48050 445 aa27.39■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.39■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.39■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 PDE8BO95263 885 aa27.38■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.38■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.38■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.38■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 LRP5O75197 1615 aa27.38■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 TAF5LO75529 589 aa27.38■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
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VSTM4-201ENST00000298454 ADCK5Q3MIX3 580 aa27.38■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.38■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa27.38■■□□□ 1.97
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VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.37■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 SBF2Q86WG5 1849 aa27.37■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.36■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.36■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 NARFQ9UHQ1 456 aa27.36■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 ERFEQ4G0M1 354 aa27.36■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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VSTM4-201ENST00000298454 CPA1P15085 419 aa27.35■■□□□ 1.97
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VSTM4-201ENST00000298454 TTC14Q96N46 770 aa27.35■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.35■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 SLC27A2O14975 620 aa27.35■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
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VSTM4-201ENST00000298454 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.34■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 LY75O60449 1722 aa27.34■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 SCN7AQ01118 1682 aa27.34■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 ZAP70P43403 619 aa27.33■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 PI16Q6UXB8 463 aa27.33■■□□□ 1.97
VSTM4-201ENST00000298454 RTL9Q8NET4 1388 aa27.33■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 LAMB2P55268 1798 aa27.32■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 MCM4P33991 863 aa27.32■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC12Q96J65 1359 aa27.32■■□□□ 1.96
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VSTM4-201ENST00000298454 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.32■■□□□ 1.96
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VSTM4-201ENST00000298454 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.31■■□□□ 1.96
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VSTM4-201ENST00000298454 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.31■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 SNAP23O00161 211 aa27.3■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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VSTM4-201ENST00000298454 EP400Q96L91 3159 aa27.29■■□□□ 1.96
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VSTM4-201ENST00000298454 PHKA1P46020 1223 aa27.28■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 PKP1Q13835 747 aa27.28■■□□□ 1.96
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VSTM4-201ENST00000298454 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
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VSTM4-201ENST00000298454 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.27■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.27■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 MAST3O60307 1309 aa27.27■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 VPS53Q5VIR6 699 aa27.26■■□□□ 1.96
VSTM4-201ENST00000298454 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.26■■□□□ 1.95
VSTM4-201ENST00000298454 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.25■■□□□ 1.95
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