RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000227089.1

Ankrd28-204, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

BASIC

Gene Ankrd28, Length 3,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm17019K7N6W5 255 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Prim1P20664 417 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ppfia3P60469 1194 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trak2Q6P9N8 913 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ccz1Q8C1Y8 480 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Def6Q8C2K1 630 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Q8C5K5 320 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Fam76aQ922G2 307 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Chmp3Q9CQ10 224 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ccdc83Q9D4V3 305 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kif24Q6NWW5 1356 aa5.4□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Btn2a2A4QPC6 514 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Exoc6bA6H5Z3 810 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Fbln2P37889 1221 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Samsn1P57725 372 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cep126Q0VBV7 1103 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Jarid2Q62315 1234 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ifit2Q64112 472 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ano1Q8BHY3 960 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 PtprvP70289 1705 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Irgm2A0A140LIF8 407 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Eif5P59325 429 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 ItpripQ3TNL8 555 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Leo1Q5XJE5 667 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pip4k2bQ80XI4 416 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Atf7Q8R0S1 413 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Osbpl5Q9ER64 874 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Golga5Q9QYE6 729 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kif3cO35066 796 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gng11P61953 73 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Spink5Q148R4 1017 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Lamb3Q61087 1168 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Hspa4Q61316 841 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ankrd13aQ80UP5 588 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Q8BZJ8 459 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Plcd1Q8R3B1 756 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Smc1bQ920F6 1248 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ivns1abpQ920Q8 642 aa5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ccdc112A0AUP1 442 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Actn3O88990 900 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cplx1P63040 134 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Chl1P70232 1209 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ubash3aQ3V3E1 624 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tmem132eQ6IEE6 982 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mtmr3Q8K296 1196 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cdca7lQ922M5 438 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gli3Q61602 1583 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gcom1E9PZ54 550 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ccdc121E9Q6D3 323 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ess2O70279 479 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Clec11aO88200 328 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Stat1P42225 749 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ttll12Q3UDE2 639 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 MyzapQ3UIJ9 466 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gas2l3Q3UWW6 683 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mctp2Q5RJH2 878 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Znf532Q6NXK2 1036 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kif11Q6P9P6 1052 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Fsd1Q7TPM6 496 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Slc26a8Q8R0C3 999 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Bmp2kQ91Z96 1138 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Lonp2Q9DBN5 852 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Zeb2Q9R0G7 1215 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Stxbp4Q9WV89 557 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ubn2Q80WC1 1314 aa5.38□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 GmnnO88513 206 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cdk4P30285 303 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ap5z1Q3U829 807 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Limch1Q3UH68 1057 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Morc2aQ69ZX6 1030 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Prdm4Q80V63 803 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cdca8Q8BHX3 289 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Slc35g1Q8BY79 368 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kcnk13Q8R1P5 405 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 PzpQ61838 1495 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 1700018F24RikB2RW27 314 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nfatc2ipO09130 412 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pde6bP23440 856 aa5.37□□□□□ -1.55
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Fkbp4P30416 458 aa5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.1 ms