RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 BDH1Q02338 343 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC63Q05C16 580 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 KLRC3Q07444 240 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 C1orf186Q6ZWK4 172 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 RNF148Q8N7C7 305 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM71CQ8NEG0 241 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM3CQ92520 227 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM121Q9BTD3 319 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 PARVBQ9HBI1 364 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ANO10Q9NW15 660 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 PRELID1Q9Y255 219 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 LAMA1P25391 3075 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 DENND4AQ7Z401 1863 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 CLUHO75153 1309 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 NDUFAB1O14561 156 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 CYTH3O43739 400 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 EFNA2O43921 213 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 DFNA5O60443 496 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 STX11O75558 287 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 FLOT1O75955 427 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 IGHV3-48P01763 117 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 CSF2P04141 144 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 HBQ1P09105 142 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ALOX5P09917 674 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF24P17028 368 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SERPINA2P20848 420 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 S100A1P23297 94 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ALDH3A1P30838 453 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 PCK1P35558 622 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 PPOXP50336 477 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC26A5P58743 744 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 LINC00315P59091 139 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 NTHL1P78549 312 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 BASP1P80723 227 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 AP1B1Q10567 949 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 WASHC5Q12768 1159 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 LINC00303Q3SY05 128 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 USH1GQ495M9 461 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM52BQ4KMG9 183 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 NLRP9Q7RTR0 991 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SKA3Q8IX90 412 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 CNNM3Q8NE01 707 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 MGARPQ8TDB4 240 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 RSPH1Q8WYR4 309 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 FGF14Q92915 247 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 UPRTQ96BW1 309 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC45Q96CN5 670 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 HAUS1Q96CS2 278 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 STARD4Q96DR4 205 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SDSLQ96GA7 329 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM101Q96IK0 257 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TXN2Q99757 166 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC39A3Q9BRY0 314 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TSGA10Q9BZW7 698 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 YIPF3Q9GZM5 350 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 DRC3Q9H069 523 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC25A51Q9H1U9 297 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SH2D2AQ9NP31 389 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 HEBP1Q9NRV9 189 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TMCO1Q9UM00 188 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 TMED5Q9Y3A6 229 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 MAB21L2Q9Y586 359 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 NBASA2RRP1 2371 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 APCP25054 2843 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 RTTNQ86VV8 2226 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 HEATR9A2RTY3 570 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 OR6C65A6NJZ3 312 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM74A7A6NL05 159 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA8KD6RF30 607 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 LSM1O15116 133 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 CETN3O15182 167 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 BAG2O95816 211 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-206ENST00000467748 MT-ATP6P00846 226 aa2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.2 ms