RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL150WQ12152 901 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HRT3Q12347 344 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CTF3Q12748 733 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ATP1P07251 545 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SSB1P11484 613 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HMG2P12684 1045 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PGI1P12709 554 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CHS2P14180 963 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TRK2P28584 889 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MRF1P30775 413 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM2P33753 639 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TTI1P36097 1038 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P AGP2P38090 596 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SSB2P40150 613 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P THI6P41835 540 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL045WP47052 634 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ALT1P52893 592 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P NBP1P52919 319 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX14P53112 341 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MUB1Q03162 620 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RGA2Q06407 1009 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SDH5Q08230 162 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SLX4Q12098 748 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PUS1Q12211 544 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TRP2P00899 507 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P GAL80P04387 435 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PCK1P10963 549 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO8P11491 566 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P BIK1P11709 440 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SIR1P21691 654 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RRT12P25381 491 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CYS3P31373 394 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P BIO2P32451 375 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL091CP33324 310 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HMT1P38074 348 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PTC4P38089 393 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P RGD1P38339 666 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ARP1P38696 384 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P GEM1P39722 662 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TGL3P40308 642 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P DAK2P43550 591 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P FYV8P46949 817 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ZAP1P47043 880 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SHE10P53075 577 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR061CP53747 219 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SLG1P54867 378 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC5P89102 971 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P GCN5Q03330 439 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P WAR1Q03631 944 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P NSE5Q03718 556 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TIF35Q04067 274 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PRM6Q04705 352 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MLH2Q07980 695 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL075CQ08234 1294 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SGT2Q12118 346 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PDH1Q12428 516 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HIS5P07172 385 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CHS1P08004 1131 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P FUS1P11710 512 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HCM1P25364 564 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MSH2P25847 964 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P KIP1P28742 1111 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PSO2P30620 661 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P EFB1P32471 206 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P STE5P32917 917 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P XRS2P33301 854 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SLA2P33338 968 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL023WP36103 277 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P DUG2P38149 878 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YBR284WP38150 797 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P SHE3P38272 425 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P LEO1P38439 464 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P KIC1P38692 1080 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P BIM1P40013 344 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P LCB2P40970 561 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TOS3P43637 560 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP8P53276 713 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR130CP53278 816 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TIM8P57744 87 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ADA2Q02336 434 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P LEE1Q02799 301 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P HER2Q03557 464 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR344CQ05510 147 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX19Q07418 342 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P ABP140Q08641 628 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P YPQ1Q12010 308 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC53Q12018 815 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P TAF10Q12030 206 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P APM4Q99186 491 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P MEX67Q99257 599 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)PtW(CCA)P CET1O13297 549 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)PtW(CCA)P VMA1P17255 1071 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)PtW(CCA)P STE11P23561 717 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)PtW(CCA)P PPH22P23595 377 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)PtW(CCA)P MCM3P24279 971 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.3 ms