RNA–Protein interactions for RNA: YOL008W

COQ10, Transcript of Coenzyme Q (ubiquinone) binding protein, yeast

Gene COQ10, Length 624 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COQ10	YOL008W	PIN2	Q12057	282 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	TOP1	P04786	769 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	NRG1	Q03125	231 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	MPH2	P0CD99	609 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	TMT1	P32643	299 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	IRR1	P40541	1150 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	GLO1	P50107	326 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	SEC5	P89102	971 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	SPO11	P23179	398 aa		3.54	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	SAK1	P38990	1142 aa		3.54	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	FMP52	P40008	231 aa		3.54	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	HAL9	Q12180	1030 aa		3.54	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	YPR071W	Q12346	211 aa		3.54	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	YLR415C	O13578	112 aa		3.53	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	CDC11	P32458	415 aa		3.53	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	SCT1	P32784	759 aa		3.53	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	SSY5	P47002	699 aa		3.53	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	TEL2	P53038	688 aa		3.53	□□□□□ -1.84
COQ10	YOL008W	YTA7	P40340	1379 aa		3.52	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	BRN1	P38170	754 aa		3.52	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	YJL206C	P39529	758 aa		3.52	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	YBR284W	P38150	797 aa		3.51	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	BCD1	P38772	366 aa		3.51	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	PFA3	P42836	336 aa		3.51	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	ASM4	Q05166	528 aa		3.51	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	TGL5	Q12043	749 aa		3.51	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	YOR022C	Q12204	715 aa		3.51	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	STE5	P32917	917 aa		3.5	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	HOS4	P40480	1083 aa		3.5	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	NIT3	P49954	291 aa		3.5	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	UBC11	P52492	156 aa		3.5	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	YAP1802	P53309	568 aa		3.5	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	RSC3	Q06639	885 aa		3.5	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	ENV7	Q12003	364 aa		3.5	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	TAF3	Q12297	353 aa		3.5	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	PRC1	P00729	532 aa		3.49	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	ORC2	P32833	620 aa		3.49	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	YBR184W	P38299	523 aa		3.49	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	ALR2	P43553	858 aa		3.49	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	ATG11	Q12527	1178 aa		3.49	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	RPN13	O13563	156 aa		3.48	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	DAL7	P21826	554 aa		3.48	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	EMP70	P32802	667 aa		3.48	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	REV7	P38927	245 aa		3.48	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	YEL020C	P39994	560 aa		3.48	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	TOP3	P13099	656 aa		3.47	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	HIR1	P32479	840 aa		3.47	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	SAP190	P36123	1033 aa		3.47	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	PET10	P36139	283 aa		3.47	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	NDC80	P40460	691 aa		3.47	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	PFD1	P46988	109 aa		3.47	□□□□□ -1.85
COQ10	YOL008W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	GLG1	P36143	616 aa		3.46	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	YBR259W	P38338	688 aa		3.46	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SIC1	P38634	284 aa		3.46	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	VAC8	P39968	578 aa		3.46	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	DOS2	P54858	310 aa		3.46	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SVF1	Q05515	481 aa		3.46	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	YCL002C	P25565	263 aa		3.45	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	BAP3	P41815	604 aa		3.45	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	CTR1	P49573	406 aa		3.45	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	TAD1	P53065	400 aa		3.45	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	FMP25	Q08023	583 aa		3.45	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.45	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	OCA5	P38738	679 aa		3.44	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	ARG2	P40360	574 aa		3.44	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	GAD1	Q04792	585 aa		3.44	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.44	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	SIR3	P06701	978 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	VPS34	P22543	875 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	BDH2	P39713	417 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	GAT1	P43574	510 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	YJR008W	P47085	338 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	RTS3	P53289	263 aa		3.43	□□□□□ -1.86
COQ10	YOL008W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.5 ms