RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	ATG19	P35193	415 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	VBA3	P25594	458 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	SFP1	P32432	683 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	RPD3	P32561	433 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	TAD1	P53065	400 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	PUS2	P53167	370 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	HDA1	P53973	706 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	YKR011C	Q02209	353 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	RSC3	Q06639	885 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	YOL073C	Q08232	322 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	MEF1	P25039	761 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	SAP190	P36123	1033 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	CDC9	P04819	755 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	PER1	P25625	357 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	SUL1	P38359	859 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	TFB2	Q02939	513 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	YCL002C	P25565	263 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	MTC2	P34246	357 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	PRC1	P00729	532 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	SHR5	P41912	237 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	TY4A-J	P47023	414 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	DNM1	P54861	757 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	TMN2	Q04562	672 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	UPC2	Q12151	913 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	SRD1	P09007	221 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	SED4	P25365	1065 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	CAF16	P43569	289 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	ALY2	P47029	1046 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	YJR142W	P47173	342 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	GUP2	Q08929	609 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	HAL9	Q12180	1030 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	YOR022C	Q12204	715 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	TRM13	Q12383	476 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL171C	YNL171C	ADR1	P07248	1323 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	DIF1	O13577	133 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	RAD18	P10862	487 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	ERG4	P25340	473 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	MCD4	P36051	919 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	STB4	P50104	949 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	YNL193W	P53870	558 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	YMR206W	Q03695	313 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	FBP1	P09201	348 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	STE14	P32584	239 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	KTR4	P38131	464 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	SDP1	P40479	209 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	HXT16	P47185	567 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	HLJ1	P48353	224 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	CRR1	Q05790	422 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	HOG1	P32485	435 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	YEL1	P34225	687 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	YHR078W	P38799	552 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	CTF8	P38877	133 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	MUK1	Q02866	612 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	MCH5	Q08777	521 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	PCL2	P25693	308 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	NHX1	Q04121	633 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	THI21	Q08975	551 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	SFL1	P20134	766 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	SSY5	P47002	699 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	ERG5	P54781	538 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	COG8	Q04632	607 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	OMS1	Q06668	471 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL171C	YNL171C	PZF1	P39933	429 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	ATF1	P40353	525 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	YFL052W	P43551	465 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	ZIP2	P53061	704 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	SWM1	Q12379	170 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	HSL7	P38274	827 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	SAK1	P38990	1142 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	STU2	P46675	888 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	YGL081W	P53156	320 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	NPY1	P53164	384 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YNL171C	YNL171C	IRC10	Q08118	586 aa		5.32	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23 ms