RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	PCK1	P10963	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	PRR1	P28708	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	KIP1	P28742	1111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	KIC1	P38692	1080 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	ATG32	P40458	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	RET3	P53600	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	ADA2	Q02336	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	ECM23	Q02710	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	TMN2	Q04562	672 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	EAF1	Q06337	982 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	SHS1	Q07657	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	STE11	P23561	717 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	COT1	P32798	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	YBR284W	P38150	797 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	BRN1	P38170	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	GYP8	P43570	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	VTC2	P43585	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	RSM26	P47141	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	HXT17	P53631	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	APM4	Q99186	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	IRA1	P18963	3092 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YNL057W	YNL057W	TAF13	P11747	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	FBP26	P32604	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	NEM1	P38757	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PIH1	P38768	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	GIP4	P39732	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	UBP5	P39944	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	CHS6	P40955	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YGR130C	P53278	816 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	GYL1	Q04322	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ECM7	Q06200	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	MPD2	Q99316	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YNL057W	YNL057W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YBL036C	P38197	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SIF2	P38262	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	RGD1	P38339	666 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	FAA3	P39002	694 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	BFA1	P47113	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ALT1	P52893	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	NMA2	P53204	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ARP5	P53946	755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ARK1	P53974	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YPR148C	Q06523	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	HRT3	Q12347	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	GAL80	P04387	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	CDC6	P09119	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	VPS3	P23643	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PEP7	P32609	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TRM2	P33753	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YBR056W	P38081	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	MMS4	P38257	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	OPY1	P38271	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SIP3	P38717	1229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	HXT13	P39924	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TAF1	P46677	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	POL31	P46957	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	ORC5	P50874	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	TUB4	P53378	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	HER2	Q03557	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	CEX1	Q12453	761 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	RPC53	P25441	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL057W	YNL057W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 78.4 ms