RNA–Protein interactions for RNA: YMR119W

ASI1, Transcript of Subunit of the nuclear inner membrane Asi ubiquitin ligase complex, yeast

Gene ASI1, Length 1,875 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ASI1	YMR119W	BIK1	P11709	440 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
ASI1	YMR119W	GIP2	P40036	548 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	RSM25	P40496	264 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	GYP8	P43570	497 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	DAS1	P47005	663 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	VPS53	P47061	822 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	PEX14	P53112	341 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	LAP2	Q10740	671 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	PIF1	P07271	859 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	ERS1	P17261	260 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	NPP1	P25353	742 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	NFS1	P25374	497 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	PLC1	P32383	869 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	MTC2	P34246	357 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	DID4	P36108	232 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YRO2	P38079	344 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	TOK1	P40310	691 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	PRY1	P47032	299 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YGR045C	P53229	120 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YNL050C	P53952	270 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YNL034W	P53963	612 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YNL018C	P53976	612 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	HFD1	Q04458	532 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	MPD2	Q99316	277 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	ADE8	P04161	214 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	SFL1	P20134	766 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	KIP1	P28742	1111 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	RAD26	P40352	1085 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	NYV1	Q12255	253 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	APC1	P53886	1748 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	TFC4	P33339	1025 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YKL151C	P36059	337 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	GPB2	P39717	880 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	MAM1	P40065	302 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	PEA2	P40091	420 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	TED1	P40533	473 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	TRE2	Q08693	809 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	SPO21	Q12411	609 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	LYS2	P07702	1392 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YEL1	P34225	687 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	IES5	P40060	125 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	CAF16	P43569	289 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YJR096W	P47137	282 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	ATG16	Q03818	150 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	RSC3	Q06639	885 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	ELG1	Q12050	791 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ASI1	YMR119W	CDC16	P09798	840 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	RAD24	P32641	659 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	REC104	P33323	182 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	SLA2	P33338	968 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	MAC1	P35192	417 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	MRPL10	P36520	322 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	HSE1	P38753	452 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	TCD1	P38756	429 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	STU2	P46675	888 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	TIM50	Q02776	476 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	GIS4	Q04233	774 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	MCD4	P36051	919 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	YFL054C	P43549	646 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	YGR021W	P53212	290 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	NCE103	P53615	221 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	SSL2	Q00578	843 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	ATP25	Q03153	612 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	PEX19	Q07418	342 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	ACM1	Q08981	209 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	SLP1	Q12232	587 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	SFI1	Q12369	946 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ASI1	YMR119W	COQ4	O13525	335 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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