RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	POM152	P39685	1337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	YER152C	P10356	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	OPI1	P21957	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	MLS1	P30952	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	ENT3	P47160	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	YNL193W	P53870	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	VPS20	Q04272	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RER2	P35196	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	CCZ1	P38273	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	BDH2	P39713	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	NPA3	P47122	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	PEX14	P53112	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	BDF2	Q07442	638 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RGD1	P38339	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	PIK1	P39104	1066 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	CNN1	P43618	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	YGL081W	P53156	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	PIB2	P53191	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	HST1	P53685	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	ARP5	P53946	755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	IRC3	Q06683	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	THI3	Q07471	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	AIM21	P40563	679 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RSB1	Q08417	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	MGM1	P32266	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	DUT1	P33317	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RSM25	P40496	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	MPH1	P40562	993 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	ENV11	P53246	860 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	TAH18	Q12181	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
LAS1	YKR063C	PEP3	P27801	918 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	ASF1	P32447	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
LAS1	YKR063C	UGA2	P38067	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	CHS7	P38843	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	IRC8	P47046	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	CTF18	P49956	741 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	YKE2	P52553	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	NTO1	Q12311	748 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	CYB2	P00175	591 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	RAD27	P26793	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	IMP2'	P32351	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	MCM7	P38132	845 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	YHL017W	P38745	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	VID28	P40547	921 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	UBX2	Q04228	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	PSF3	Q12146	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	AIM44	Q99299	758 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	LAM4	P38800	1345 aa		4.84	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PFF1	P38244	976 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
LAS1	YKR063C	SNM1	P40993	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	CIR1	P42940	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	IOC3	P43596	787 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	INM2	Q05533	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PEX19	Q07418	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RPN12	P32496	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	DOM34	P33309	386 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PET112	P33893	541 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	MXR1	P40029	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	YIR042C	P40586	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	BUD6	P41697	788 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	EEB1	Q02891	456 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	ROT1	Q03691	256 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	DUS4	Q06063	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	KRE2	P27809	442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.9 ms