RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	TPP1	Q03796	238 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	CYC7	P00045	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	YKU70	P32807	602 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	KTR4	P38131	464 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	ALY2	P47029	1046 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	UBA2	P52488	636 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	HOL1	P53389	586 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	YPL277C	Q08989	487 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	YVC1	Q12324	675 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VMA22	YHR060W	SSM4	P40318	1319 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RER1	P25560	188 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	PER1	P25625	357 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RPC82	P32349	654 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	AFR1	P33304	620 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SLA2	P33338	968 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TFC3	P34111	1160 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	PPE1	P38796	400 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MXR1	P40029	184 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YER158C	P40095	573 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MNT3	P40549	630 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	ECM9	Q02202	377 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	VPS30	Q02948	557 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	BLS1	Q06071	122 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SSP2	Q08646	371 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	APM4	Q99186	491 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	FOB1	O13329	566 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TRP3	P00937	484 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MSM1	P22438	575 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MSH1	P25846	959 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	IMP2'	P32351	346 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	OMA1	P36163	345 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	UGA2	P38067	497 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MAL31	P38156	614 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RAD26	P40352	1085 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	HOS4	P40480	1083 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	QRI7	P43122	407 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	BNA2	P47125	453 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YHM2	Q04013	314 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TRE1	Q08919	783 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	KCS1	Q12494	1050 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MSS18	P08593	268 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	NPP1	P25353	742 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MCM10	P32354	571 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TOA1	P32773	286 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	NFU1	P32860	256 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MAC1	P35192	417 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SDS22	P36047	338 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TOS1	P38288	455 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SAW1	P39735	261 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SHR5	P41912	237 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	EAR1	Q03212	550 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YPR196W	Q06595	470 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MDM38	Q08179	573 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YOL087C	Q99247	1116 aa		5	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	COQ4	O13525	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	DIF1	O13577	133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	FUN30	P31380	1131 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	DAL3	P32459	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	NGG1	P32494	702 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
VMA22	YHR060W	MDL2	P33311	773 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	RRN3	P36070	627 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YKR073C	P36153	106 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	ERT1	P38140	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	PSY4	P38193	441 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YHL012W	P38709	493 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	GPB2	P39717	880 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	NPY1	P53164	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	TNA1	P53322	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	GTR1	Q00582	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	HFI1	Q12060	488 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	MED1	Q12321	566 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	ADP1	P25371	1049 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YSC84	P32793	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	SAP190	P36123	1033 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	PEX7	P39108	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	NDE1	P40215	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA22	YHR060W	YFL052W	P43551	465 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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