RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 AACSQ86V21 672 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 EYA2O00167 538 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 SETDB2Q96T68 719 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 SCN7AQ01118 1682 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 SSFA2P28290 1259 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 SUSD4Q5VX71 490 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 CNTROBQ8N137 903 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 SASH1O94885 1247 aa27.63■■■□□ 2.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.63■■■□□ 2.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 TXNRD1Q16881 649 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 RTL9Q8NET4 1388 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 NPHP1O15259 732 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 REC8O95072 547 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGA6P23229 1130 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 YY1P25490 414 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 TNNI3KQ59H18 835 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 HIP1O00291 1037 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 TFCP2Q12800 502 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 RILPL2Q969X0 211 aa27.59■■■□□ 2.01
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CAPNS1-212ENST00000591041 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM177BA6PVY3 158 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 PHF14O94880 888 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 LAMB2P55268 1798 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 TICAM2Q86XR7 235 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 RUFY2Q8WXA3 655 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.56■■■□□ 2
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CAPNS1-212ENST00000591041 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.55■■■□□ 2
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CAPNS1-212ENST00000591041 GREM2Q9H772 168 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 METTL24Q5JXM2 366 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 GORABQ5T7V8 394 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP3Q96P20 1036 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.53■■■□□ 2
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CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5JP18859 108 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 SPON1Q9HCB6 807 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-212ENST00000591041 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 BECN1Q14457 450 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 MCCP23508 829 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 ERFEQ4G0M1 354 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC24Q50LG9 513 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNE4Q8N205 404 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-212ENST00000591041 C4AP0C0L4 1744 aa27.48■■□□□ 1.99
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